RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	NPC2	Q12408	173 aa		0.74	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	ENA5	Q12691	1091 aa		0.74	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	TAO3	P40468	2376 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	SSM4	P40318	1319 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	BI4	P03879	638 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	MKK2	P32491	506 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	EMP70	P32802	667 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	MIC60	P36112	540 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	ARP1	P38696	384 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	STB5	P38699	743 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	CSM2	P40465	213 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	MMR1	Q06324	491 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	MET7	Q08645	548 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	GUP2	Q08929	609 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	HKR1	P41809	1802 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	VAB2	P40003	282 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	ZRG8	P40021	1076 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	MDM1	Q01846	1127 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	PSF3	Q12146	194 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	UPC2	Q12151	913 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	RAV1	P47104	1357 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	TEL1	P38110	2787 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	PER1	P25625	357 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	SFP1	P32432	683 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	BFA1	P47113	574 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	RSM26	P47141	266 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	YJR107W	P47145	328 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	NUT2	Q06213	157 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	YPL260W	Q08977	551 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	GPR1	Q12361	961 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	PMD1	P32634	1753 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	TOM1	Q03280	3268 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	MET4	P32389	672 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	PCA1	P38360	1216 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	LYS14	P40971	790 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	YNL034W	P53963	612 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	YNL018C	P53976	612 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	PEX13	P80667	386 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	ADI1	Q03677	179 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	GIN4	Q12263	1142 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	YOR131C	Q12486	218 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	PTC5	Q12511	572 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AI1	Q0050	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.71	□□□□□ -2.3	not detected
AI1	Q0050	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	XBP1	P40489	647 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	MAF1	P41910	395 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	ROD1	Q02805	837 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	YML020W	Q03722	664 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	YML053C	Q04978	212 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	EST2	Q06163	884 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	ESC2	Q06340	456 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	TLG2	Q08144	397 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	PIN2	Q12057	282 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	YPL066W	Q12194	479 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	UBR2	Q07963	1872 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	LAM4	P38800	1345 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	NUP145	P49687	1317 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	RTC1	Q08281	1341 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	CBP1	P07252	654 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	SWI6	P09959	803 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	PCK1	P10963	549 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	PPH3	P32345	308 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	OCT1	P35999	772 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	LEU5	P38702	357 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	PNT1	P38969	423 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	MET13	P53128	600 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	LIF1	P53150	421 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	SIW14	P53965	281 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	DNM1	P54861	757 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	YPL068C	Q02749	293 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	UBP16	Q02863	499 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AI1	Q0050	ENT2	Q05785	613 aa		0.71	□□□□□ -2.3

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