RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NECTIN2Q92692 538 aa20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF428Q96B54 188 aa20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SCARF1Q14162 830 aa20.2■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.19■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.18■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GPR25O00155 361 aa20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TAF1P21675 1872 aa20.17■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM89AQ96GI7 184 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.15■□□□□ 0.82
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FKTNO75072 461 aa20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UFL1O94874 794 aa20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SREBF2Q12772 1141 aa20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MOB2Q70IA6 237 aa20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 USP17L8P0C7I0 530 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NF2P35240 595 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TM4SF4P48230 202 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GGA1Q9UJY5 639 aa20.13■□□□□ 0.81
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.12■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.11■□□□□ 0.81
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.1■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF609O15014 1411 aa20.1■□□□□ 0.81
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 USP17L3A6NCW0 530 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 USP17L4A6NCW7 530 aa20.08■□□□□ 0.81
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ALDH1A1P00352 501 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OGFOD1Q8N543 542 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SCN9AQ15858 1988 aa20.06■□□□□ 0.8
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PODNQ7Z5L7 613 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GMLQ99445 158 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRIM17Q9Y577 477 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 COL4A1P02462 1669 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRKG1Q13976 671 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 XDHP47989 1333 aa20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 POTEFA5A3E0 1075 aa20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KRT24Q2M2I5 525 aa20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FBXW7Q969H0 707 aa20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATP2B4P23634 1241 aa20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HYPKQ9NX55 129 aa20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 WNT10BO00744 389 aa20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 INHBEP58166 350 aa20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPRYD7Q5W111 196 aa20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HOXB7P09629 217 aa19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
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