RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 TRAF1Q13077 416 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 TMCO5BA8MYB1 307 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 RPS6KA5O75582 802 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC192P0DO97 292 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 WWC2Q6AWC2 1192 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 TEX11Q8IYF3 940 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 ERLIN2O94905 339 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 CASTP20810 708 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 MIEF2Q96C03 454 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 ACBD3Q9H3P7 528 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 FCHSD2O94868 740 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM27P14373 513 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 MCM2P49736 904 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 RWDD2BP57060 319 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC27Q2M243 656 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 ELF1P32519 619 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 ADCY2Q08462 1091 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 PDRG1Q9NUG6 133 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 IRAK4Q9NWZ3 460 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 USP6P35125 1406 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A1B0GUA9 196 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 EXOC5O00471 708 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 MTA1Q13330 715 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM57Q8N5G2 664 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 CLIP2Q9UDT6 1046 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 ADAM21Q9UKJ8 722 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 TTC21AQ8NDW8 1320 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 APBB1O00213 710 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 SCP2P22307 547 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 DCTN1Q14203 1278 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 LNPKQ9C0E8 428 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 USP32Q8NFA0 1604 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM5Q9C035 493 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 PKP1Q13835 747 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 ARHGEF25Q86VW2 580 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 POTEDQ86YR6 584 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 ARMC2Q8NEN0 867 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 ANAPC4Q9UJX5 808 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 PES1O00541 588 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 CRYMQ14894 314 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM200AQ8TCP9 573 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 PHACTR3Q96KR7 559 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 ARFGAP3Q9NP61 516 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 GNAI1P63096 354 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 NFE2L2Q16236 605 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 SULT6B1Q6IMI4 303 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 ACSBG1Q96GR2 724 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 AK9Q5TCS8 1911 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 SSH2Q76I76 1423 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 BRD1O95696 1058 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 NBPF14Q5TI25 921 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD45Q5TZF3 282 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 QRICH2Q9H0J4 1663 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 SETDB1Q15047 1291 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 KIAA1328Q86T90 577 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 ZDHHC9Q9Y397 364 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 UBE2HP62256 183 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-218ENST00000590367 NUCB1Q02818 461 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.9 ms