RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
CAPNS1-206ENST00000588815 CRY2Q49AN0 593 aa37.98■■■■□ 3.67
CAPNS1-206ENST00000588815 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP37.98■■■■□ 3.674e-10■■■■□ 22.9
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP37.98■■■■□ 3.67
CAPNS1-206ENST00000588815 PI4K2BQ8TCG2 481 aa37.97■■■■□ 3.67
CAPNS1-206ENST00000588815 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP37.97■■■■□ 3.67
CAPNS1-206ENST00000588815 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC24Q8N4L8 307 aa37.96■■■■□ 3.67
CAPNS1-206ENST00000588815 VGLL2Q8N8G2 317 aa37.96■■■■□ 3.67
CAPNS1-206ENST00000588815 PDE8BO95263 885 aa37.96■■■■□ 3.67
CAPNS1-206ENST00000588815 BRIP1Q9BX63 1249 aa37.95■■■■□ 3.67
CAPNS1-206ENST00000588815 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP37.95■■■■□ 3.67
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GUL7 405 aa37.94■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS8P62241 208 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 COL4A1P02462 1669 aa37.93■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP37.92■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa37.92■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 SDSP20132 328 aa37.91■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TSHZ3Q63HK5 1081 aa37.91■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP2B3Q16720 1220 aa37.9■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 MSL1Q68DK7 614 aa37.9■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 NEUROD6Q96NK8 337 aa37.9■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 DBNDD2Q9BQY9 259 aa37.9■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC45O75419 566 aa37.89■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP5JP18859 108 aa37.89■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP37.89■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TIMM10P62072 90 aa37.89■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 GRAPQ13588 217 aa37.89■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP37.89■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
CAPNS1-206ENST00000588815 PDE6BP35913 854 aa37.88■■■■□ 3.65
CAPNS1-206ENST00000588815 LPIN2Q92539 896 aa37.87■■■■□ 3.65
CAPNS1-206ENST00000588815 CHRNDQ07001 517 aa37.86■■■■□ 3.65
CAPNS1-206ENST00000588815 CNTROBQ8N137 903 aa37.85■■■■□ 3.65
CAPNS1-206ENST00000588815 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP37.85■■■■□ 3.65
CAPNS1-206ENST00000588815 CRAMP1Q96RY5 1269 aa37.85■■■■□ 3.65
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa37.84■■■■□ 3.65
CAPNS1-206ENST00000588815 FGFR2P21802 821 aa37.84■■■■□ 3.65
CAPNS1-206ENST00000588815 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC158Q5M9N0 1113 aa37.84■■■■□ 3.65
CAPNS1-206ENST00000588815 CASC1Q6TDU7 716 aa37.84■■■■□ 3.65
CAPNS1-206ENST00000588815 XAGE2Q96GT9 111 aa37.84■■■■□ 3.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD2Q9GZV1 360 aa37.84■■■■□ 3.65
CAPNS1-206ENST00000588815 MINPP1Q9UNW1 487 aa37.84■■■■□ 3.65
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC5A1P13866 664 aa37.83■■■■□ 3.65
CAPNS1-206ENST00000588815 TMC4Q7Z404 712 aa37.82■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC37AA6NMS7 1700 aa37.81■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 GORABQ5T7V8 394 aa37.81■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 AKAP11Q9UKA4 1901 aa37.8■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 BBOX1O75936 387 aa37.8■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP37.8■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE4AQ14139 1066 aa37.8■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 EVI5LQ96CN4 794 aa37.8■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF13BQ9NQT8 1826 aa37.79■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa37.79■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 RILPL2Q969X0 211 aa37.79■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP37.79■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 NPR1P16066 1061 aa37.78■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 SRGNP10124 158 aa37.77■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 TAF5LO75529 589 aa37.77■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 CACNA1SQ13698 1873 aa37.77■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 HAUS7Q99871 368 aa37.77■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 BOLA2Q9H3K6 86 aa37.77■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 DLEC1Q9Y238 1755 aa37.76■■■■□ 3.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ALDH1B1P30837 517 aa37.76■■■■□ 3.63
CAPNS1-206ENST00000588815 TICAM2Q86XR7 235 aa37.76■■■■□ 3.63
CAPNS1-206ENST00000588815 ADORA1P30542 326 aa37.75■■■■□ 3.63
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC39AQ5SRH9 613 aa37.75■■■■□ 3.63
CAPNS1-206ENST00000588815 MASTLQ96GX5 879 aa37.74■■■■□ 3.63
CAPNS1-206ENST00000588815 MYH13Q9UKX3 1938 aa37.74■■■■□ 3.63
CAPNS1-206ENST00000588815 MYH7P12883 1935 aa37.73■■■■□ 3.63
CAPNS1-206ENST00000588815 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
CAPNS1-206ENST00000588815 C10orf71Q711Q0 1435 aa37.72■■■■□ 3.63
CAPNS1-206ENST00000588815 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa37.71■■■■□ 3.63
CAPNS1-206ENST00000588815 MTFR1LQ9H019 292 aa37.71■■■■□ 3.63
CAPNS1-206ENST00000588815 RFX7Q2KHR2 1363 aa37.71■■■■□ 3.63
CAPNS1-206ENST00000588815 HIP1O00291 1037 aa37.7■■■■□ 3.63
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP37.7■■■■□ 3.63
CAPNS1-206ENST00000588815 XDHP47989 1333 aa37.69■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 H0YIN7 160 aa37.69■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 STYK1Q6J9G0 422 aa37.69■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 LEMD3Q9Y2U8 911 aa37.69■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 CHMLP26374 656 aa37.68■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC102BQ68D86 513 aa37.68■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNJ4P48050 445 aa37.67■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 LTBP1Q14766 1721 aa37.67■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 SEC24BO95487 1268 aa37.66■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 C2CD5Q86YS7 1000 aa37.66■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 SP8Q8IXZ3 490 aa37.65■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
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