RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FZD9O00144 591 aa27.86■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.86■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MINPP1Q9UNW1 487 aa27.86■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C6orf229H3BNL8 230 aa27.85■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKRD44Q8N8A2 993 aa27.85■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TBC1D16Q8TBP0 767 aa27.85■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EYA3Q99504 573 aa27.85■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POLLQ9UGP5 575 aa27.85■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GGA1Q9UJY5 639 aa27.85■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RCAN3Q9UKA8 241 aa27.85■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UFL1O94874 794 aa27.84■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TAF7LQ5H9L4 462 aa27.84■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WDR90Q96KV7 1748 aa27.84■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WASHC4Q2M389 1173 aa27.83■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MEIS3Q99687 375 aa27.83■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF541Q9H0D2 1346 aa27.83■■■□□ 2.05
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GNAI3P08754 354 aa27.82■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATP2B4P23634 1241 aa27.82■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EIF6P56537 245 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKRD2Q9GZV1 360 aa27.82■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NMRK2Q9NPI5 230 aa27.82■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.81■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNRF3Q9ULT6 936 aa27.8■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A1B0GUL6 1792 aa27.8■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa27.79■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIF3CO14782 793 aa27.78■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DDNO94850 711 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHRNDQ07001 517 aa27.78■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CNNM1Q9NRU3 951 aa27.78■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LEMD3Q9Y2U8 911 aa27.78■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RIMBP2O15034 1052 aa27.77■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MS4A1P11836 297 aa27.77■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPC2Q8N158 579 aa27.77■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MED23Q9ULK4 1368 aa27.76■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RRAGCQ9HB90 399 aa27.76■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RLBP1P12271 317 aa27.75■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.74■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCN4AP35499 1836 aa27.74■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF804BA4D1E1 1349 aa27.73■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DBNDD1Q9H9R9 158 aa27.73■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 G3V3G9 751 aa27.72■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ECE2O60344 883 aa27.72■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KCNJ4P48050 445 aa27.72■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CXCL9Q07325 125 aa27.72■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DCAF8Q5TAQ9 597 aa27.72■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IQCA1LA6NCM1 817 aa27.71■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 YDJCA8MPS7 323 aa27.71■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GNAI2P04899 355 aa27.71■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CIAPIN1Q6FI81 312 aa27.71■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GJA3Q9Y6H8 435 aa27.71■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MROH5Q6ZUA9 1318 aa27.7■■■□□ 2.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POTECB2RU33 542 aa27.7■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNIP1Q15025 636 aa27.7■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DOK7Q18PE1 504 aa27.7■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa27.7■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TAF5LO75529 589 aa27.69■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MTX1Q13505 466 aa27.69■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PANK1Q8TE04 598 aa27.69■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAD17O75943 681 aa27.68■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TOMM70O94826 608 aa27.68■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KLHDC4Q8TBB5 520 aa27.68■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRC24Q50LG9 513 aa27.67■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HACL1Q9UJ83 578 aa27.67■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FBXO3Q9UK99 471 aa27.67■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EYA2O00167 538 aa27.66■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLIN1O60240 522 aa27.66■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PODNQ7Z5L7 613 aa27.66■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PSME4Q14997 1843 aa27.66■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCN9AQ15858 1988 aa27.66■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 METTL24Q5JXM2 366 aa27.65■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COA1Q9GZY4 146 aa27.65■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IRS2Q9Y4H2 1338 aa27.65■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SRGAP3O43295 1099 aa27.64■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KLRK1P26718 216 aa27.64■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCNN1DP51172 638 aa27.64■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C1QTNF8P60827 252 aa27.64■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBE4AQ14139 1066 aa27.64■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TXNRD3Q86VQ6 643 aa27.64■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SNAP23O00161 211 aa27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms