RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553628.1

AC009396.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC009396.1, Length 1,079 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009396.1-201ENST00000553628 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.51□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 TMC7Q7Z402 723 aa9.51□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.51□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.51□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 STK17AQ9UEE5 414 aa9.51□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 NESP48681 1621 aa9.5□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 CPB1P15086 417 aa9.5□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 PDE3BQ13370 1112 aa9.5□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.5□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 FAM35AQ86V20 835 aa9.5□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 MYO15BQ96JP2 1530 aa9.5□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 J3QW42 95 aa9.49□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 KIF4AO95239 1232 aa9.49□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 PCSK7Q16549 785 aa9.49□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 PERM1Q5SV97 790 aa9.49□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9.49□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 KANK3Q6NY19 840 aa9.49□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.49□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 LPIN3Q9BQK8 851 aa9.49□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.48□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.48□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 EREGO14944 169 aa9.48□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 PHACTR2O75167 634 aa9.48□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 SIK1P57059 783 aa9.48□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.48□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 TMC1Q8TDI8 760 aa9.48□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 M0R082 166 aa9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 CES1P23141 567 aa9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 HYAL2Q12891 473 aa9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 ORC1Q13415 861 aa9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF417Q8TAU3 575 aa9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 NUDT8Q8WV74 236 aa9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 DMRTB1Q96MA1 342 aa9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 RRAGCQ9HB90 399 aa9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.46□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 ASB16Q96NS5 453 aa9.46□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9.46□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.46□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 FRRS1LQ9P0K9 344 aa9.46□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.46□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.45□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 ACPPP15309 386 aa9.45□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 DSC3Q14574 896 aa9.45□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.45□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.45□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 TREHO43280 583 aa9.44□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 ATP11AP98196 1134 aa9.44□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 GRIK5Q16478 980 aa9.44□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa9.44□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 CEP120Q8N960 986 aa9.44□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 PLD4Q96BZ4 506 aa9.44□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 PRDM6Q9NQX0 595 aa9.44□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 GHRHP01286 108 aa9.43□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.43□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 PMEPA1Q969W9 287 aa9.43□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.43□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 NID1P14543 1247 aa9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 TRIM11Q96F44 468 aa9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 LATS2Q9NRM7 1088 aa9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 SMARCA2P51531 1590 aa9.41□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 LILRB5O75023 590 aa9.41□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.41□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 TTC9Q92623 222 aa9.41□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 NEFLP07196 543 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 CCDC27Q2M243 656 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 PODNQ7Z5L7 613 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 SPACA7Q96KW9 195 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 CSRNP1Q96S65 589 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 RBSNQ9H1K0 784 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
AC009396.1-201ENST00000553628 NFKBIEO00221 500 aa9.39□□□□□ -0.91
AC009396.1-201ENST00000553628 GNB5O14775 395 aa9.39□□□□□ -0.91
AC009396.1-201ENST00000553628 TRPA1O75762 1119 aa9.39□□□□□ -0.91
AC009396.1-201ENST00000553628 EDN3P14138 238 aa9.39□□□□□ -0.91
AC009396.1-201ENST00000553628 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.9 ms