RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 USP21Q9UK80 565 aa8.35□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 GPLD1P80108 840 aa8.34□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.34□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.34□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 TP53INP1Q96A56 240 aa8.34□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.34□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.34□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.34□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 TOPBP1Q92547 1522 aa8.34□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.33□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 CLIP1P30622 1438 aa8.33□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.33□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 FBXO11Q86XK2 927 aa8.33□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.33□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 ARTNQ5T4W7 220 aa8.32□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 TREML1Q86YW5 311 aa8.32□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.32□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 TTC9Q92623 222 aa8.32□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.32□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 ERICH3Q5RHP9 1530 aa8.31□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 EGFRP00533 1210 aa8.31□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.31□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.31□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.31□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 NRLP54845 237 aa8.3□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 COX20Q5RI15 118 aa8.3□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.3□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.3□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.3□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.3□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.29□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 XYLBO75191 536 aa8.29□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 NOS3P29474 1203 aa8.29□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 J3QW42 95 aa8.28□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.28□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.28□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 PRDM2Q13029 1718 aa8.28□□□□□ -1.08
TRDN-205ENST00000546248 PRMT3O60678 531 aa8.27□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 MMP20O60882 483 aa8.27□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 FAM26DQ5JW98 314 aa8.27□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.27□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.27□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.27□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.27□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.27□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.26□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 DLL1O00548 723 aa8.26□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 SIK1P57059 783 aa8.26□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.26□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 OCLNQ16625 522 aa8.26□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 HOMEZQ8IX15 550 aa8.26□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 PLD4Q96BZ4 506 aa8.26□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 PSAPP07602 524 aa8.25□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 LRP8Q14114 963 aa8.25□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.25□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 ARAP1Q96P48 1450 aa8.25□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.24□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 STK32AQ8WU08 396 aa8.24□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 SOX18P35713 384 aa8.23□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.22□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 TNFRSF10BO14763 440 aa8.22□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 ALX3O95076 343 aa8.22□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 GHRHP01286 108 aa8.22□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 C16orf46Q6P387 395 aa8.22□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.22□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.22□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.21□□□□□ -1.09
TRDN-205ENST00000546248 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
TRDN-205ENST00000546248 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
TRDN-205ENST00000546248 NBPF11Q86T75 865 aa8.21□□□□□ -1.1
TRDN-205ENST00000546248 NLRP13Q86W25 1043 aa8.21□□□□□ -1.1
TRDN-205ENST00000546248 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.21□□□□□ -1.1
TRDN-205ENST00000546248 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.21□□□□□ -1.1
TRDN-205ENST00000546248 SETDB1Q15047 1291 aa8.2□□□□□ -1.1
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