RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531352.5

ACER3-210, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACER3, Length 2,093 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-210ENST00000531352 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.64□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 SNAP23O00161 211 aa14.64□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 RRP1P56182 461 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 AOC3Q16853 763 aa14.64□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.64□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.64□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 GNAI3P08754 354 aa14.63□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.63□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.63□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.63□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.62□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 C6orf229H3BNL8 230 aa14.62□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 TAF5LO75529 589 aa14.62□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 LRRC24Q50LG9 513 aa14.62□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 A0A1B0GUL6 1792 aa14.61□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 RIMBP2O15034 1052 aa14.61□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 PPIP5K2O43314 1243 aa14.61□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 CHRNDQ07001 517 aa14.61□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.61□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.61□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 XDHP47989 1333 aa14.61□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 UFL1O94874 794 aa14.61□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 GNAI2P04899 355 aa14.61□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.61□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.6□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 WASHC4Q2M389 1173 aa14.6□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 GGA1Q9UJY5 639 aa14.6□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.59□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 FZD9O00144 591 aa14.59□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 KLRK1P26718 216 aa14.59□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 PDE3AQ14432 1141 aa14.59□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.59□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.59□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.59□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 MS4A1P11836 297 aa14.59□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 MTX1Q13505 466 aa14.59□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.59□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 SCN9AQ15858 1988 aa14.59□□□□□ -0.07
ACER3-210ENST00000531352 YDJCA8MPS7 323 aa14.58□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 SRGAP3O43295 1099 aa14.58□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.58□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 DOK7Q18PE1 504 aa14.57□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.57□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 JDP2Q8WYK2 163 aa14.57□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 SIL1Q9H173 461 aa14.57□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 VPS33BQ9H267 617 aa14.57□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.57□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.57□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.57□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 GLTPD2A6NH11 291 aa14.57□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 ATP2B4P23634 1241 aa14.57□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 CRBNQ96SW2 442 aa14.57□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.57□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.57□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.56□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 NIM1KQ8IY84 436 aa14.56□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.56□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.56□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.56□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 POTECB2RU33 542 aa14.56□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 EYA2O00167 538 aa14.56□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.56□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 COPRSQ9NQ92 184 aa14.56□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.56□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 CXCL9Q07325 125 aa14.55□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 EYA3Q99504 573 aa14.55□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 RAD17O75943 681 aa14.54□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 ATP8B2P98198 1209 aa14.54□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 CEP85Q6P2H3 762 aa14.54□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 SIRT2Q8IXJ6 389 aa14.54□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 ECE2O60344 883 aa14.54□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 POLA2Q14181 598 aa14.54□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 METTL24Q5JXM2 366 aa14.54□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.54□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 RRAGCQ9HB90 399 aa14.54□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 CEP350Q5VT06 3117 aa14.54□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 MED23Q9ULK4 1368 aa14.53□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.53□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 PDE8BO95263 885 aa14.53□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 SSH3Q8TE77 659 aa14.53□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.53□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 KCNJ4P48050 445 aa14.53□□□□□ -0.08
ACER3-210ENST00000531352 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.6 ms