RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481600.5

EDRF1-208, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, human

TSL 2

Gene EDRF1, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EDRF1-208	ENST00000481600	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	SASH1	O94885	1247 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	KLHL34	Q8N239	644 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	KCNB2	Q92953	911 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	MYD88	Q99836	296 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	CCDC69	A6NI79	296 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	TXLNA	P40222	546 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	CCP110	O43303	1012 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600		A0A0D9SFI3	127 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	SMARCE1	Q969G3	411 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	SLC39A6	Q13433	755 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	TDO2	P48775	406 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
EDRF1-208	ENST00000481600	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	COPS6	Q7L5N1	327 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	ORAI2	Q96SN7	254 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600		A0A087WZG4	1122 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	CDKL5	O76039	1030 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	ZNF790	Q6PG37	636 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	AK7	Q96M32	723 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	TCHH	Q07283	1943 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	EPS15	P42566	896 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	GCKR	Q14397	625 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	TTC6	Q86TZ1	520 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	UTY	O14607	1347 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	METTL24	Q5JXM2	366 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	IGKV5-2	P06315	115 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	KAZALD1	Q96I82	304 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	LTN1	O94822	1766 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	AIDA	Q96BJ3	306 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	NFAT5	O94916	1531 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	C8orf76	Q96K31	380 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	CCDC66	A2RUB6	948 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	ELP1	O95163	1332 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	TYRO3	Q06418	890 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	PXDN	Q92626	1479 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	ST3GAL1	Q11201	340 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	UBXN4	Q92575	508 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	ANO10	Q9NW15	660 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	CBFA2T2	O43439	604 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	ATP5J	P18859	108 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24

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