RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480416.1

TNS1-215, Transcript of tensin 1, human

TSL 2

Gene TNS1, Length 335 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNS1-215	ENST00000480416	DLL1	O00548	723 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	ITPK1	Q13572	414 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	LINC01559	Q495D7	138 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	TSC1	Q92574	1164 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	PALLD	Q8WX93	1383 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	SZT2	Q5T011	3432 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	AOC2	O75106	756 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	GYS1	P13807	737 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	SSFA2	P28290	1259 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	GRM1	Q13255	1194 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	DGKZ	Q13574	1117 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	CFAP99	D6REC4	459 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	LMNB1	P20700	586 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	TMF1	P82094	1093 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	NNT	Q13423	1086 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	SCARF1	Q14162	830 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	PIGB	Q92521	554 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	MEGF6	O75095	1541 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	NFKBIE	O00221	500 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	UPP2	O95045	317 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	ADH1C	P00326	375 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	DDR1	Q08345	913 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	NR5A1	Q13285	461 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	NME9	Q86XW9	330 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	PNMA1	Q8ND90	353 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	LTN1	O94822	1766 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	C4A	P0C0L4	1744 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	LILRB3	O75022	631 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	SIK1	P57059	783 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	ARID5B	Q14865	1188 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	ZIC5	Q96T25	663 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	MAP10	Q9P2G4	905 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	ITGB4	P16144	1822 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	CYP27B1	O15528	508 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	ERFE	Q4G0M1	354 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	CNTROB	Q8N137	903 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	IP6K1	Q92551	441 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	CAPNS2	Q96L46	248 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	CDK15	Q96Q40	435 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	STK17A	Q9UEE5	414 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	LTBP1	Q14766	1721 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TNS1-215	ENST00000480416	WIPF1	O43516	503 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TNS1-215	ENST00000480416	TM4SF1	P30408	202 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TNS1-215	ENST00000480416	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TNS1-215	ENST00000480416	CST9	Q5W186	159 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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