RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479756.1

RARRES1-204, Transcript of retinoic acid receptor responder 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARRES1, Length 839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1-204ENST00000479756 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.48■■□□□ 1.67
RARRES1-204ENST00000479756 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
RARRES1-204ENST00000479756 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
RARRES1-204ENST00000479756 KCNQ5Q9NR82 932 aa25.48■■□□□ 1.67
RARRES1-204ENST00000479756 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
RARRES1-204ENST00000479756 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.47■■□□□ 1.67
RARRES1-204ENST00000479756 TAF1P21675 1872 aa25.47■■□□□ 1.67
RARRES1-204ENST00000479756 VIL1P09327 827 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
RARRES1-204ENST00000479756 ZNF428Q96B54 188 aa25.46■■□□□ 1.67
RARRES1-204ENST00000479756 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.45■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 SCARF1Q14162 830 aa25.44■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 GCC1Q96CN9 775 aa25.44■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 FAM89AQ96GI7 184 aa25.44■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 TBC1D8O95759 1140 aa25.41■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 RIPK4P57078 832 aa25.41■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.41■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.41■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.4■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.4■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.4■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 UFL1O94874 794 aa25.39■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
RARRES1-204ENST00000479756 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.38■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.38■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 GGA1Q9UJY5 639 aa25.38■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.37■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.37■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 USP17L8P0C7I0 530 aa25.37■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.37■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.37■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.37■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.36■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 GPR25O00155 361 aa25.36■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 ZNF609O15014 1411 aa25.36■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 MOB2Q70IA6 237 aa25.35■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 NF2P35240 595 aa25.34■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 SREBF2Q12772 1141 aa25.34■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.34■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 TM4SF4P48230 202 aa25.33■■□□□ 1.65
RARRES1-204ENST00000479756 SCN9AQ15858 1988 aa25.33■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 FKTNO75072 461 aa25.32■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 USP17L3A6NCW0 530 aa25.31■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 USP17L4A6NCW7 530 aa25.31■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.31■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 COL4A1P02462 1669 aa25.3■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 RALBP1Q15311 655 aa25.3■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 KRT24Q2M2I5 525 aa25.3■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 GMLQ99445 158 aa25.3■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.29■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.29■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 PODNQ7Z5L7 613 aa25.29■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.29■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 HYPKQ9NX55 129 aa25.29■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 OGFOD1Q8N543 542 aa25.28■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 CHL1O00533 1208 aa25.27■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 HOXB7P09629 217 aa25.27■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 XDHP47989 1333 aa25.27■■□□□ 1.64
RARRES1-204ENST00000479756 ATP2B4P23634 1241 aa25.26■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.26■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.26■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.26■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 ALDH1A1P00352 501 aa25.25■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 GOLGA2Q08379 1002 aa25.25■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 NEUROD2Q15784 382 aa25.25■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.25■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.25■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.23■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 FBXW7Q969H0 707 aa25.23■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 PSME4Q14997 1843 aa25.22■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 PDE8AO60658 829 aa25.22■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 TRIM17Q9Y577 477 aa25.22■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 MYO3BQ8WXR4 1341 aa25.21■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 WNT10BO00744 389 aa25.21■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 PRKG1Q13976 671 aa25.21■■□□□ 1.63
RARRES1-204ENST00000479756 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms