RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 EHHADHQ08426 723 aa8.48□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 GRIN2CQ14957 1233 aa8.48□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.48□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 TMC1Q8TDI8 760 aa8.48□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.48□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 SETDB2Q96T68 719 aa8.48□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.48□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.48□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR182O15218 404 aa8.47□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM157BP0CG42 384 aa8.47□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 MAPK8P45983 427 aa8.47□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 PLCB3Q01970 1234 aa8.47□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 TNP2Q05952 138 aa8.47□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 TYRO3Q06418 890 aa8.47□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.47□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.47□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 UBXN4Q92575 508 aa8.47□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 CITED4Q96RK1 184 aa8.47□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 BCL11AQ9H165 835 aa8.47□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
STRADBP1-201ENST00000478954 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.46□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 ZBTB39O15060 712 aa8.46□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 RAPGEF3O95398 923 aa8.46□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.46□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.46□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM129BQ96TA1 746 aa8.46□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.46□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 STIM2Q9P246 746 aa8.46□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.45□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 CD33P20138 364 aa8.45□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 FGFR3P22607 806 aa8.45□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 CTBSQ01459 385 aa8.45□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.45□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.45□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 TMC4Q7Z404 712 aa8.45□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.45□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.45□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.45□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 C2CD2LO14523 706 aa8.44□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 AAMPQ13685 434 aa8.44□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.44□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.44□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 CEP63Q96MT8 703 aa8.44□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 BRD7Q9NPI1 651 aa8.44□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 MBIPQ9NS73 344 aa8.44□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.44□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 MX2P20592 715 aa8.43□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 IDH3AP50213 366 aa8.43□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 DAB2P98082 770 aa8.43□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 FANCCQ00597 558 aa8.43□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 IER5Q5VY09 327 aa8.43□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.43□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 ATCAYQ86WG3 371 aa8.43□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 IFT43Q96FT9 208 aa8.43□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 HIF1AQ16665 826 aa8.42□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 TREML1Q86YW5 311 aa8.42□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.42□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 PHF24Q9UPV7 400 aa8.42□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 USP20Q9Y2K6 914 aa8.42□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 IGF1RP08069 1367 aa8.42□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.41□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.41□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 SORBS3O60504 671 aa8.41□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 MICAL2O94851 1124 aa8.41□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 ADAMTS2O95450 1211 aa8.41□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 INPP5BP32019 993 aa8.41□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 PIP4K2BP78356 416 aa8.41□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 SPATA32Q96LK8 384 aa8.41□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 TINF2Q9BSI4 451 aa8.41□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 MRS2Q9HD23 443 aa8.41□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 FANCAO15360 1455 aa8.4□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 OPLAHO14841 1288 aa8.4□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 PSMD2Q13200 908 aa8.4□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 WHAMMQ8TF30 809 aa8.4□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC30A3Q99726 388 aa8.4□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 MARK1Q9P0L2 795 aa8.4□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.4□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 POLIQ9UNA4 740 aa8.4□□□□□ -1.06
STRADBP1-201ENST00000478954 POGZQ7Z3K3 1410 aa8.39□□□□□ -1.07
STRADBP1-201ENST00000478954 SLURP2P0DP57 97 aa8.39□□□□□ -1.07
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