RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
RBM39-231	ENST00000477334	LILRB5	O75023	590 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RBM39-231	ENST00000477334	SASH3	O75995	380 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RBM39-231	ENST00000477334	NFKB1	P19838	968 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RBM39-231	ENST00000477334	GJD3	Q8N144	294 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RBM39-231	ENST00000477334	IGFLR1	Q9H665	355 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RBM39-231	ENST00000477334	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
RBM39-231	ENST00000477334	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
RBM39-231	ENST00000477334	FAM229A	H3BQW9	127 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM39-231	ENST00000477334	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
RBM39-231	ENST00000477334	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
RBM39-231	ENST00000477334	USP5	P45974	858 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM39-231	ENST00000477334	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
RBM39-231	ENST00000477334	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM39-231	ENST00000477334	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM39-231	ENST00000477334	APBA3	O96018	575 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	EGFR	P00533	1210 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	GATA4	P43694	442 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	TMC7	Q7Z402	723 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	NAGPA	Q9UK23	515 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	MAP3K6	O95382	1288 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	RARA	P10276	462 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	EHHADH	Q08426	723 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	NUDT8	Q8WV74	236 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	NACC1	Q96RE7	527 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	CITED4	Q96RK1	184 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	FAM129B	Q96TA1	746 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	ZFAT	Q9P243	1243 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	GPR182	O15218	404 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	PDE3B	Q13370	1112 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	DOC2B	Q14184	412 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	PCSK7	Q16549	785 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	NLRP13	Q86W25	1043 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	ASB16	Q96NS5	453 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	ELP3	Q9H9T3	547 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	IGHA2	P01877	340 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	GRIK4	Q16099	956 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334		A0A0A0MRY4	1105 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	MMP20	O60882	483 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	XKR5	Q6UX68	686 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	FAM35A	Q86V20	835 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	TNFRSF21	O75509	655 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	CPB1	P15086	417 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	ELN	P15502	786 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	RAC1	P63000	192 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RBM39-231	ENST00000477334	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	TREH	O43280	583 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	GPLD1	P80108	840 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	ORC1	Q13415	861 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	CNTN3	Q9P232	1028 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	C9orf172	C9J069	976 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	PHACTR2	O75167	634 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	PSAP	P07602	524 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	ITGB7	P26010	798 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	PLCB3	Q01970	1234 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	PERM1	Q5SV97	790 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	ILDR2	Q71H61	639 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	SELP	P16109	830 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	MAPK8	P45983	427 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	NRL	P54845	237 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	DSC3	Q14574	896 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	OR13H1	Q8NG92	308 aa		7.44	□□□□□ -1.22

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