RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 MON2Q7Z3U7 1717 aa5.83□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 GRM1Q13255 1194 aa5.83□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 MSS51Q4VC12 460 aa5.83□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 PNMA1Q8ND90 353 aa5.83□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC17A8Q8NDX2 589 aa5.83□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 CABP1Q9NZU7 370 aa5.83□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 FKBPLQ9UIM3 349 aa5.83□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa5.82□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa5.82□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 NR1I2O75469 434 aa5.82□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 ATG7O95352 703 aa5.82□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 FBXO45P0C2W1 286 aa5.82□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 JUNDP17535 347 aa5.82□□□□□ -1.48
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ECHDC1-211ENST00000460558 MAP2K2P36507 400 aa5.82□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP4CP60510 307 aa5.82□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP5.82□□□□□ -1.48
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ECHDC1-211ENST00000460558 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa5.82□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa5.82□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 LINC00116Q8NCU8 138 aa5.82□□□□□ -1.48
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ECHDC1-211ENST00000460558 A0A0C4DFX4 3053 aa5.81□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 MEGF6O75095 1541 aa5.81□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa5.81□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 ZBBXA8MT70 800 aa5.81□□□□□ -1.48
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ECHDC1-211ENST00000460558 SIK1P57059 783 aa5.81□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 SEMA3FQ13275 785 aa5.81□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
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ECHDC1-211ENST00000460558 CYP4F22Q6NT55 531 aa5.8□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa5.8□□□□□ -1.48
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ECHDC1-211ENST00000460558 MAP10Q9P2G4 905 aa5.8□□□□□ -1.48
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ECHDC1-211ENST00000460558 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 CNTROBQ8N137 903 aa5.79□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 TTLL6Q8N841 843 aa5.79□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 WNT2BQ93097 391 aa5.79□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 STAC3Q96MF2 364 aa5.79□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 MPHOSPH9Q99550 1183 aa5.79□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 OCSTAMPQ9BR26 566 aa5.79□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 EVA1BQ9NVM1 165 aa5.79□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 AOC2O75106 756 aa5.78□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 CCNYL3P0C7X3 344 aa5.78□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNA1Q09470 495 aa5.78□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa5.78□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 DCAF11Q8TEB1 546 aa5.78□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP5.78□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 NRXN2Q9P2S2 1712 aa5.78□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 USP31Q70CQ4 1352 aa5.78□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa5.78□□□□□ -1.48
ECHDC1-211ENST00000460558 CD163L1Q9NR16 1453 aa5.77□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 POTEMA6NI47 508 aa5.77□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 GOLGA8CPA6NN73 597 aa5.77□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 EPHX2P34913 555 aa5.77□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 ITPK1Q13572 414 aa5.77□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 PDXDC2PQ6P474 469 aa5.77□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 NYAP1Q6ZVC0 841 aa5.77□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 AEBP1Q8IUX7 1158 aa5.77□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa5.77□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 PIGBQ92521 554 aa5.77□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 IP6K1Q92551 441 aa5.77□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 HACL1Q9UJ83 578 aa5.77□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
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