RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448188.1

SNORD57-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 57, humanhuman

BASIC

Gene SNORD57, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD57-201ENST00000448188 LCE3AQ5TA76 89 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 SPRED2Q7Z698 418 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 SULF1Q8IWU6 871 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 DNAJC10Q8IXB1 793 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 SHISA5Q8N114 240 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 FBXL6Q8N531 539 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 NLRP7Q8WX94 980 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 PIK3R5Q8WYR1 880 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 WASF1Q92558 559 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 TEPSINQ96N21 525 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 CARD14Q9BXL6 1004 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 CRIM1Q9NZV1 1036 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 SLC5A6Q9Y289 635 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 USP19O94966 1318 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 MUC5ACP98088 5654 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 TENM4Q6N022 2769 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 HIVEP2P31629 2446 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 PPFIA2O75334 1257 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 GLDCP23378 1020 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 RAB15P59190 212 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 KCNC3Q14003 757 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 RTN1Q16799 776 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 LCE1AQ5T7P2 110 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 TCERG1LQ5VWI1 586 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 CRIP3Q6Q6R5 217 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 CLEC10AQ8IUN9 316 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 TMEM130Q8N3G9 435 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 DTWD1Q8N5C7 304 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 GIMAP7Q8NHV1 300 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 EDAQ92838 391 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 TNFRSF25Q93038 417 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 NLRP3Q96P20 1036 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 FAM83CQ9BQN1 747 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 TNMDQ9H2S6 317 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 KCNF1Q9H3M0 494 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 MAP10Q9P2G4 905 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 KIF7Q2M1P5 1343 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 MUC19Q7Z5P9 8384 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD57-201ENST00000448188 COL4A3Q01955 1670 aa0.53□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 A0A1W2PRU2 124 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 KDM4AO75164 1064 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 OATP04181 439 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 TGFB2P61812 414 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 PTGDRQ13258 359 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 RTP5Q14D33 572 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 BEND4Q6ZU67 534 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 FLAD1Q8NFF5 587 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 CRAMP1Q96RY5 1269 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 CRISPLD1Q9H336 500 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 SEMA3GQ9NS98 782 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 KCNK4Q9NYG8 393 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 MARK1Q9P0L2 795 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 RYR1P21817 5038 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 ABCA12Q86UK0 2595 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 C6orf229H3BNL8 230 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 IKBKBO14920 756 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 SYNJ2O15056 1496 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 HOXA2O43364 376 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 BNIP3Q12983 259 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 UVSSAQ2YD98 709 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP0.51□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 SPRED1Q7Z699 444 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 FAM20CQ8IXL6 584 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 SYT8Q8NBV8 401 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 PI4K2BQ8TCG2 481 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 THSD7BQ9C0I4 1608 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 NCOR2Q9Y618 2525 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 CACNA1BQ00975 2339 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 TSPOAP1O95153 1857 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 MST1RQ04912 1400 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 MYO18BQ8IUG5 2567 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 GLI1P08151 1106 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 CD8BP10966 210 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 BMP3P12645 472 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD57-201ENST00000448188 FHL2Q14192 279 aa0.5□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms