RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-202ENST00000444040 Q6ZUG5 572 aa19.01■□□□□ 0.63
SHQ1-202ENST00000444040 HELLSQ9NRZ9 838 aa19.01■□□□□ 0.63
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SHQ1-202ENST00000444040 STOX1Q6ZVD7 989 aa19■□□□□ 0.63
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SHQ1-202ENST00000444040 JAK2O60674 1132 aa18.98■□□□□ 0.63
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SHQ1-202ENST00000444040 CEP126Q9P2H0 1117 aa18.94■□□□□ 0.62
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SHQ1-202ENST00000444040 DNAJC10Q8IXB1 793 aa18.92■□□□□ 0.62
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SHQ1-202ENST00000444040 CTDNEP1O95476 244 aa18.91■□□□□ 0.62
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC192P0DO97 292 aa18.91■□□□□ 0.62
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SHQ1-202ENST00000444040 NUP62CLQ9H1M0 184 aa18.91■□□□□ 0.62
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SHQ1-202ENST00000444040 TERF1P54274 439 aa18.91■□□□□ 0.62
SHQ1-202ENST00000444040 FGD1P98174 961 aa18.91■□□□□ 0.62
SHQ1-202ENST00000444040 FAM89AQ96GI7 184 aa18.91■□□□□ 0.62
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SHQ1-202ENST00000444040 APOBRQ0VD83 1088 aa18.9■□□□□ 0.62
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SHQ1-202ENST00000444040 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
SHQ1-202ENST00000444040 MAP3K11Q16584 847 aa18.9■□□□□ 0.62
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SHQ1-202ENST00000444040 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SHQ1-202ENST00000444040 H3BQV1 296 aa18.89■□□□□ 0.61
SHQ1-202ENST00000444040 FOXP2O15409 715 aa18.89■□□□□ 0.61
SHQ1-202ENST00000444040 CAMK4Q16566 473 aa18.89■□□□□ 0.61
SHQ1-202ENST00000444040 IFFO2Q5TF58 517 aa18.89■□□□□ 0.61
SHQ1-202ENST00000444040 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SHQ1-202ENST00000444040 TTLL5Q6EMB2 1281 aa18.88■□□□□ 0.61
SHQ1-202ENST00000444040 KIF6Q6ZMV9 814 aa18.88■□□□□ 0.61
SHQ1-202ENST00000444040 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa18.88■□□□□ 0.61
SHQ1-202ENST00000444040 ADD1P35611 737 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
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