RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423421.5

CXorf40A-204, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXorf40A, Length 1,403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-204ENST00000423421 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
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CXorf40A-204ENST00000423421 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.32■■□□□ 1.64
CXorf40A-204ENST00000423421 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CXorf40A-204ENST00000423421 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CXorf40A-204ENST00000423421 GPR162Q16538 588 aa25.31■■□□□ 1.64
CXorf40A-204ENST00000423421 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.31■■□□□ 1.64
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CXorf40A-204ENST00000423421 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.31■■□□□ 1.64
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CXorf40A-204ENST00000423421 METTL24Q5JXM2 366 aa25.3■■□□□ 1.64
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CXorf40A-204ENST00000423421 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.3■■□□□ 1.64
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CXorf40A-204ENST00000423421 TAF1P21675 1872 aa25.29■■□□□ 1.64
CXorf40A-204ENST00000423421 CACNA1SQ13698 1873 aa25.29■■□□□ 1.64
CXorf40A-204ENST00000423421 GRIN3BO60391 1043 aa25.29■■□□□ 1.64
CXorf40A-204ENST00000423421 LRRC24Q50LG9 513 aa25.29■■□□□ 1.64
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CXorf40A-204ENST00000423421 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.28■■□□□ 1.64
CXorf40A-204ENST00000423421 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.28■■□□□ 1.64
CXorf40A-204ENST00000423421 ATP2B4P23634 1241 aa25.27■■□□□ 1.64
CXorf40A-204ENST00000423421 GGA1Q9UJY5 639 aa25.27■■□□□ 1.64
CXorf40A-204ENST00000423421 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.26■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.26■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.26■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 SPEF2Q9C093 1822 aa25.25■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.25■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 PDE8BO95263 885 aa25.25■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 EYA3Q99504 573 aa25.25■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 GPSM2P81274 684 aa25.24■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.24■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 PSMD1Q99460 953 aa25.24■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 VPS33BQ9H267 617 aa25.24■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 C6orf229H3BNL8 230 aa25.23■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 UBE4AQ14139 1066 aa25.23■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.23■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
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CXorf40A-204ENST00000423421 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.22■■□□□ 1.63
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CXorf40A-204ENST00000423421 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.22■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.22■■□□□ 1.63
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CXorf40A-204ENST00000423421 UFL1O94874 794 aa25.21■■□□□ 1.63
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CXorf40A-204ENST00000423421 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.21■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 GPR108Q9NPR9 543 aa25.21■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.21■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 TFCP2Q12800 502 aa25.2■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 OLFM4Q6UX06 510 aa25.2■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 LPIN2Q92539 896 aa25.2■■□□□ 1.63
CXorf40A-204ENST00000423421 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.2■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 COL4A1P02462 1669 aa25.2■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 APBB1O00213 710 aa25.2■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 SLC5A1P13866 664 aa25.2■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 WASHC4Q2M389 1173 aa25.2■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.2■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 SASH1O94885 1247 aa25.19■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.19■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 G3V3G9 751 aa25.18■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 IGHDP01880 384 aa25.18■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 ATP2B3Q16720 1220 aa25.18■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.18■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.17■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 SMC5Q8IY18 1101 aa25.17■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 POLLQ9UGP5 575 aa25.17■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.16■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 GORABQ5T7V8 394 aa25.15■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.15■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 VPS37DQ86XT2 251 aa25.15■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 MED23Q9ULK4 1368 aa25.15■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 A0A1B0GUL7 405 aa25.14■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 TNNI3KQ59H18 835 aa25.14■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.14■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 JDP2Q8WYK2 163 aa25.14■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.14■■□□□ 1.62
CXorf40A-204ENST00000423421 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.13■■□□□ 1.61
CXorf40A-204ENST00000423421 NFKBIEO00221 500 aa25.13■■□□□ 1.61
CXorf40A-204ENST00000423421 PPIP5K2O43314 1243 aa25.13■■□□□ 1.61
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