RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 SLC51AQ86UW1 340 aa36.63■■■■□ 3.45
ECHS1-201ENST00000368547 FBXO3Q9UK99 471 aa36.63■■■■□ 3.45
ECHS1-201ENST00000368547 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP36.63■■■■□ 3.45
ECHS1-201ENST00000368547 ATG9AQ7Z3C6 839 aa36.63■■■■□ 3.45
ECHS1-201ENST00000368547 TMC4Q7Z404 712 aa36.63■■■■□ 3.45
ECHS1-201ENST00000368547 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa36.63■■■■□ 3.45
ECHS1-201ENST00000368547 CIAO1O76071 339 aa36.62■■■■□ 3.45
ECHS1-201ENST00000368547 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
ECHS1-201ENST00000368547 DCTPP1Q9H773 170 aa36.62■■■■□ 3.45
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC37AA6NMS7 1700 aa36.62■■■■□ 3.45
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
ECHS1-201ENST00000368547 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
ECHS1-201ENST00000368547 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa36.6■■■■□ 3.45
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
ECHS1-201ENST00000368547 MINPP1Q9UNW1 487 aa36.59■■■■□ 3.45
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1B0GUL6 1792 aa36.59■■■■□ 3.45
ECHS1-201ENST00000368547 IL15P40933 162 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
ECHS1-201ENST00000368547 SP8Q8IXZ3 490 aa36.59■■■■□ 3.45
ECHS1-201ENST00000368547 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa36.58■■■■□ 3.45
ECHS1-201ENST00000368547 CHRNDQ07001 517 aa36.57■■■■□ 3.44
ECHS1-201ENST00000368547 OLFM4Q6UX06 510 aa36.57■■■■□ 3.44
ECHS1-201ENST00000368547 C7orf43Q8WVR3 580 aa36.57■■■■□ 3.44
ECHS1-201ENST00000368547 BCS1LQ9Y276 419 aa36.57■■■■□ 3.44
ECHS1-201ENST00000368547 MROH5Q6ZUA9 1318 aa36.57■■■■□ 3.44
ECHS1-201ENST00000368547 APBB1O00213 710 aa36.56■■■■□ 3.44
ECHS1-201ENST00000368547 C21orf2O43822 256 aa36.56■■■■□ 3.44
ECHS1-201ENST00000368547 METTL24Q5JXM2 366 aa36.56■■■■□ 3.44
ECHS1-201ENST00000368547 SASH1O94885 1247 aa36.55■■■■□ 3.44
ECHS1-201ENST00000368547 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
ECHS1-201ENST00000368547 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
ECHS1-201ENST00000368547 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa36.54■■■■□ 3.44
ECHS1-201ENST00000368547 GCC1Q96CN9 775 aa36.54■■■■□ 3.44
ECHS1-201ENST00000368547 RAB11FIP3O75154 756 aa36.52■■■■□ 3.44
ECHS1-201ENST00000368547 ERC1Q8IUD2 1116 aa36.52■■■■□ 3.44
ECHS1-201ENST00000368547 TFCP2Q12800 502 aa36.52■■■■□ 3.44
ECHS1-201ENST00000368547 SMC5Q8IY18 1101 aa36.52■■■■□ 3.44
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD2Q9GZV1 360 aa36.52■■■■□ 3.44
ECHS1-201ENST00000368547 CEP126Q9P2H0 1117 aa36.52■■■■□ 3.44
ECHS1-201ENST00000368547 TAF5LO75529 589 aa36.51■■■■□ 3.43
ECHS1-201ENST00000368547 VGLL2Q8N8G2 317 aa36.51■■■■□ 3.43
ECHS1-201ENST00000368547 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa36.51■■■■□ 3.43
ECHS1-201ENST00000368547 GPSM2P81274 684 aa36.5■■■■□ 3.43
ECHS1-201ENST00000368547 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
ECHS1-201ENST00000368547 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
ECHS1-201ENST00000368547 LTBP1Q14766 1721 aa36.5■■■■□ 3.43
ECHS1-201ENST00000368547 PDE8BO95263 885 aa36.49■■■■□ 3.43
ECHS1-201ENST00000368547 RHPN1Q8TCX5 695 aa36.49■■■■□ 3.43
ECHS1-201ENST00000368547 KIF1BPQ96EK5 621 aa36.49■■■■□ 3.43
ECHS1-201ENST00000368547 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa36.48■■■■□ 3.43
ECHS1-201ENST00000368547 XDHP47989 1333 aa36.48■■■■□ 3.43
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC93Q567U6 631 aa36.47■■■■□ 3.43
ECHS1-201ENST00000368547 LRRCC1Q9C099 1032 aa36.47■■■■□ 3.43
ECHS1-201ENST00000368547 SOGA3Q5TF21 947 aa36.46■■■■□ 3.43
ECHS1-201ENST00000368547 MPNDQ8N594 471 aa36.46■■■■□ 3.43
ECHS1-201ENST00000368547 PODXL2Q9NZ53 605 aa36.46■■■■□ 3.43
ECHS1-201ENST00000368547 SNED1Q8TER0 1413 aa36.46■■■■□ 3.43
ECHS1-201ENST00000368547 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa36.45■■■■□ 3.43
ECHS1-201ENST00000368547 SNAP23O00161 211 aa36.45■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD45Q5TZF3 282 aa36.44■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 BCL11AQ9H165 835 aa36.44■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 DUOX1Q9NRD9 1551 aa36.43■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa36.42■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 GRIPAP1Q4V328 841 aa36.42■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 RTKN2Q8IZC4 609 aa36.42■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 GGA1Q9UJY5 639 aa36.42■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 KCNJ4P48050 445 aa36.41■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 AKAP2Q9Y2D5 859 aa36.41■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 LEMD3Q9Y2U8 911 aa36.41■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF804BA4D1E1 1349 aa36.41■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 UFL1O94874 794 aa36.41■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D16Q8TBP0 767 aa36.41■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 POLLQ9UGP5 575 aa36.41■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP36.4■■■■□ 3.427e-10■■□□□ 11.6
ECHS1-201ENST00000368547 ATP2B4P23634 1241 aa36.4■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 ATP2B3Q16720 1220 aa36.4■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 TNNI3KQ59H18 835 aa36.4■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa36.4■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF609O15014 1411 aa36.39■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 FGFR2P21802 821 aa36.39■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 UBE4AQ14139 1066 aa36.39■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 GPR108Q9NPR9 543 aa36.39■■■■□ 3.42
ECHS1-201ENST00000368547 C6orf229H3BNL8 230 aa36.38■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1B0GUL7 405 aa36.37■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 TIMM10P62072 90 aa36.37■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 NUCB1Q02818 461 aa36.37■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 LPIN2Q92539 896 aa36.37■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 ARAP2Q8WZ64 1704 aa36.36■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 AACSQ86V21 672 aa36.35■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 NEUROD6Q96NK8 337 aa36.35■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 PSMD1Q99460 953 aa36.35■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 SLC5A1P13866 664 aa36.34■■■■□ 3.41
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