RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365359.1

RNU6-1138P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1138, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1138P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1138P-201ENST00000365359 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 WISP1O95388 367 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 EGFRP00533 1210 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GHRHP01286 108 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PSAPP07602 524 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PCSK7Q16549 785 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TMEM164Q5U3C3 297 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 C16orf46Q6P387 395 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GPR152Q8TDT2 470 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CARD10Q9BWT7 1032 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 UBAP1LF5GYI3 381 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ACPPP15309 386 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SETDB1Q15047 1291 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IGF2-ASQ6U949 168 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NBPF11Q86T75 865 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ATCAYQ86WG3 371 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 DTWD1Q8N5C7 304 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GALNT11Q8NCW6 608 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TTC9Q92623 222 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 KCNK4Q9NYG8 393 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SEPT3Q9UH03 358 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 A6NHS1 94 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 F8W735 103 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TRPA1O75762 1119 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 BRD2P25440 801 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ZAP70P43403 619 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 LRP8Q14114 963 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CEP135Q66GS9 1140 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PRR23CQ6ZRP0 262 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NLRP13Q86W25 1043 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RASSF4Q9H2L5 321 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 AKTIPQ9H8T0 292 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 KANSL3Q9P2N6 904 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ARID3CA6NKF2 412 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GLB1P16278 677 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SSTR4P31391 388 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SWI5Q1ZZU3 235 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OR13H1Q8NG92 308 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TMEM63CQ9P1W3 806 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CNTN3Q9P232 1028 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MED26O95402 600 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FSTP19883 344 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SOX18P35713 384 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 HYAL2Q12891 473 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 HGSNATQ68CP4 663 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ACAD11Q709F0 780 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 UBASH3BQ8TF42 649 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PIK3R5Q8WYR1 880 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 HHIPQ96QV1 700 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RBSNQ9H1K0 784 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 C11orf16Q9NQ32 467 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PPME1Q9Y570 386 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CARNS1A5YM72 827 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TM4SF5O14894 197 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ADAM11O75078 769 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ATG7O95352 703 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 EPHA1P21709 976 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CDC27P30260 824 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MTMR3Q13615 1198 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ARMC10Q8N2F6 343 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 COL26A1Q96A83 441 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 KLHDC7BQ96G42 594 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ELP3Q9H9T3 547 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 STIM2Q9P246 746 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FSCN2O14926 492 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TGFB1P01137 390 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ATP2B4P23634 1241 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CD68P34810 354 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 Q6ZS46 218 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NCAPG2Q86XI2 1143 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TMEM130Q8N3G9 435 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CEP120Q8N960 986 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 C1orf127Q8N9H9 656 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 EDEM1Q92611 657 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SPACA7Q96KW9 195 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PBX4Q9BYU1 374 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GGNBP2Q9H3C7 697 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PCMTD2Q9NV79 361 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RNF112Q9ULX5 631 aa3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms