RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 CALML4Q96GE6 196 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 PRKAR2BP31323 418 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 ELF2Q15723 593 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 CABP2Q9NPB3 220 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 IL16Q14005 1332 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 RUFY4Q6ZNE9 571 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 EFCC1Q9HA90 598 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 CNNM1Q9NRU3 951 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 CNNM3Q8NE01 707 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 FCHSD2O94868 740 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 IMPACTQ9P2X3 320 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 HMGXB3Q12766 1538 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 SERPINA10Q9UK55 444 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 MAPKBP1O60336 1514 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 PHACTR2O75167 634 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 MTMR3Q13615 1198 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBTB9Q96C00 473 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 ZEB2O60315 1214 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 NUTM2GQ5VZR2 741 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 AP1ARQ63HQ0 302 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC102BQ68D86 513 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 POGZQ7Z3K3 1410 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP1R9BQ96SB3 815 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 EVCP57679 992 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 CPLX4Q7Z7G2 160 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 ERMNQ8TAM6 284 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 SYT10Q6XYQ8 523 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 ARMC9Q7Z3E5 817 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 EVI5O60447 810 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 CNPY4Q8N129 248 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 TTC22Q5TAA0 569 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM27P14373 513 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 SSH1Q8WYL5 1049 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP2R3AQ06190 1150 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 GOLGA5Q8TBA6 731 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 HAUS2Q9NVX0 235 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 STK24Q9Y6E0 443 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 TMTC2Q8N394 836 aa12.02□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 CPLX3Q8WVH0 158 aa12.02□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 OAS2P29728 719 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC26Q8TAB7 109 aa12.02□□□□□ -0.48
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBTB16Q05516 673 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 C9orf84Q5VXU9 1444 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 GOLGA8OA6NCC3 632 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 GOLGA8NF8WBI6 632 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 SRGAP3O43295 1099 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 USP5P45974 858 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 NCAPGQ9BPX3 1015 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 BIN1O00499 593 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 HVCN1Q96D96 273 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 MXRA7P84157 204 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 VWA3BQ502W6 1294 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 CFAP43Q8NDM7 1665 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 PEG3Q9GZU2 1588 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 MED4Q9NPJ6 270 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 HAUS8Q9BT25 410 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC62Q6P9F0 684 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAJC25Q9H1X3 360 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 GCKP35557 465 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 IQCA1Q86XH1 822 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 MACROD2A1Z1Q3 448 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 ADGBQ8N7X0 1667 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC96Q2M329 555 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 NDUFAB1O14561 156 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 PPFIA4O75335 1185 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 EVI5LQ96CN4 794 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 NAIPQ13075 1403 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 FERMT2Q96AC1 680 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 GRIN2BQ13224 1484 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 PRC1O43663 620 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 NUF2Q9BZD4 464 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 AOPEPQ8N6M6 819 aa12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 149 ms