RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 GTF3C6Q969F1 213 aa9.31□□□□□ -0.92
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PKHD1-201ENST00000340994 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
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PKHD1-201ENST00000340994 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.31□□□□□ -0.92
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PKHD1-201ENST00000340994 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
PKHD1-201ENST00000340994 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
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PKHD1-201ENST00000340994 HIP1RO75146 1068 aa9.29□□□□□ -0.92
PKHD1-201ENST00000340994 SLMAPQ14BN4 828 aa9.29□□□□□ -0.92
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PKHD1-201ENST00000340994 NSD3Q9BZ95 1437 aa9.28□□□□□ -0.92
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PKHD1-201ENST00000340994 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
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