RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299705.9

TMED3-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMED3, Length 1,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3-201ENST00000299705 SIL1Q9H173 461 aa22.33■■□□□ 1.16
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TMED3-201ENST00000299705 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
TMED3-201ENST00000299705 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.32■■□□□ 1.16
TMED3-201ENST00000299705 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TMED3-201ENST00000299705 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.32■■□□□ 1.16
TMED3-201ENST00000299705 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.32■■□□□ 1.16
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TMED3-201ENST00000299705 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.3■■□□□ 1.16
TMED3-201ENST00000299705 BCS1LQ9Y276 419 aa22.3■■□□□ 1.16
TMED3-201ENST00000299705 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.3■■□□□ 1.16
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TMED3-201ENST00000299705 RAB11FIP3O75154 756 aa22.29■■□□□ 1.16
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TMED3-201ENST00000299705 CHRNDQ07001 517 aa22.29■■□□□ 1.16
TMED3-201ENST00000299705 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.29■■□□□ 1.16
TMED3-201ENST00000299705 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.28■■□□□ 1.16
TMED3-201ENST00000299705 GCC1Q96CN9 775 aa22.28■■□□□ 1.16
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TMED3-201ENST00000299705 METTL24Q5JXM2 366 aa22.28■■□□□ 1.16
TMED3-201ENST00000299705 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.28■■□□□ 1.16
TMED3-201ENST00000299705 SASH1O94885 1247 aa22.27■■□□□ 1.16
TMED3-201ENST00000299705 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.27■■□□□ 1.16
TMED3-201ENST00000299705 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.27■■□□□ 1.16
TMED3-201ENST00000299705 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.27■■□□□ 1.16
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TMED3-201ENST00000299705 A0A1B0GUL6 1792 aa22.26■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 PDE8BO95263 885 aa22.26■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 GPSM2P81274 684 aa22.26■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 OLFM4Q6UX06 510 aa22.26■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 SLC51AQ86UW1 340 aa22.26■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 MPNDQ8N594 471 aa22.26■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.26■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
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TMED3-201ENST00000299705 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.25■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.25■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 LTBP1Q14766 1721 aa22.25■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 TFCP2Q12800 502 aa22.24■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.24■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 TAF5LO75529 589 aa22.23■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 ATP2B4P23634 1241 aa22.23■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.23■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 GGA1Q9UJY5 639 aa22.23■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 UBE4AQ14139 1066 aa22.22■■□□□ 1.15
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TMED3-201ENST00000299705 GPR108Q9NPR9 543 aa22.22■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.22■■□□□ 1.15
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TMED3-201ENST00000299705 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.21■■□□□ 1.15
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TMED3-201ENST00000299705 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.21■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 POLLQ9UGP5 575 aa22.21■■□□□ 1.15
TMED3-201ENST00000299705 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.2■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.2■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 UFL1O94874 794 aa22.2■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 KCNJ4P48050 445 aa22.2■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 LPIN2Q92539 896 aa22.2■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.19■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 APBB1O00213 710 aa22.19■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 GPR162Q16538 588 aa22.19■■□□□ 1.14
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TMED3-201ENST00000299705 VPS33BQ9H267 617 aa22.19■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 C6orf229H3BNL8 230 aa22.18■■□□□ 1.14
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TMED3-201ENST00000299705 TNNI3KQ59H18 835 aa22.18■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 EYA3Q99504 573 aa22.18■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.18■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 SNAP23O00161 211 aa22.17■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 NFKBIEO00221 500 aa22.17■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 GRIN3BO60391 1043 aa22.17■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.17■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.17■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.17■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 ZNF609O15014 1411 aa22.17■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 A0A1B0GUL7 405 aa22.16■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.16■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 SLC5A1P13866 664 aa22.16■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.16■■□□□ 1.14
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