RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293230.9

CYGB-201, Transcript of cytoglobin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYGB, Length 2,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYGB-201ENST00000293230 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CYGB-201ENST00000293230 CIAO1O76071 339 aa23.14■■□□□ 1.3
CYGB-201ENST00000293230 PSMA5P28066 241 aa23.14■■□□□ 1.3
CYGB-201ENST00000293230 NECAB1Q8N987 351 aa23.14■■□□□ 1.3
CYGB-201ENST00000293230 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
CYGB-201ENST00000293230 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
CYGB-201ENST00000293230 A0A1B0GUL7 405 aa23.14■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 GOLIM4O00461 696 aa23.14■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 STX6O43752 255 aa23.14■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 HLFQ16534 295 aa23.14■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 PALLDQ8WX93 1383 aa23.13■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.13■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 GJB2P29033 226 aa23.13■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 VPS72Q15906 364 aa23.13■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.13■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.13■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 SYNE4Q8N205 404 aa23.13■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.13■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.13■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 RPS6KB1P23443 525 aa23.13■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.13■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.12■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 CLCN1P35523 988 aa23.11■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.11■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 MBD3O95983 291 aa23.11■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 GPTP24298 496 aa23.11■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.11■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 EXOC5O00471 708 aa23.1■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 USP48Q86UV5 1035 aa23.1■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.1■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.09■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 F13A1P00488 732 aa23.09■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.09■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 CSF1RP07333 972 aa23.08■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 CYP21A2P08686 494 aa23.08■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 NLRP10Q86W26 655 aa23.08■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.08■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 MTMR6Q9Y217 621 aa23.08■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.08■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 ADORA1P30542 326 aa23.08■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CYGB-201ENST00000293230 SYCE3A1L190 88 aa23.07■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 PRDM4Q9UKN5 801 aa23.07■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 A0A0G2JS52 829 aa23.06■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 ANKRD1Q15327 319 aa23.06■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 BARGINQ6ZT62 677 aa23.06■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.06■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 RBSNQ9H1K0 784 aa23.06■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 SPEF2Q9C093 1822 aa23.06■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 NUP98P52948 1817 aa23.06■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 KRT32Q14532 448 aa23.06■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.06■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.05■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 DDB1Q16531 1140 aa23.05■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 NEK1Q96PY6 1258 aa23.05■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.05■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.05■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.04■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 XAGE2Q96GT9 111 aa23.04■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 FBXO3Q9UK99 471 aa23.04■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 LAMA4Q16363 1823 aa23.04■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.04■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 PDCL3Q9H2J4 239 aa23.04■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 GREM2Q9H772 168 aa23.04■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 MAST3O60307 1309 aa23.04■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 ATRNO75882 1429 aa23.04■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 STK3Q13188 491 aa23.03■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 SCARF1Q14162 830 aa23.03■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 LRSAM1Q6UWE0 723 aa23.03■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.03■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 MYH3P11055 1940 aa23.03■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 A0A0G2JLW4 131 aa23.03■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.03■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.02■■□□□ 1.28
CYGB-201ENST00000293230 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CYGB-201ENST00000293230 ITGA6P23229 1130 aa23.01■■□□□ 1.27
CYGB-201ENST00000293230 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms