RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.16■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 CTAGE15A4D2H0 777 aa24.16■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 CTAGE8P0CG41 777 aa24.16■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 LMAN1P49257 510 aa24.16■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 CTAGE6Q86UF2 777 aa24.16■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 CTAGE4Q8IX94 777 aa24.16■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 DNAI1Q9UI46 699 aa24.16■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.15■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 AOPEPQ8N6M6 819 aa24.15■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 SCLT1Q96NL6 688 aa24.15■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 CTNNA2P26232 953 aa24.15■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 SPTLC2O15270 562 aa24.15■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 TYRO3Q06418 890 aa24.15■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 MAATS1Q7Z4T9 603 aa24.15■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 RLBP1P12271 317 aa24.14■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 STAT6P42226 847 aa24.14■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 ERMNQ8TAM6 284 aa24.14■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 CABP5Q9NP86 173 aa24.14■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 STX8Q9UNK0 236 aa24.14■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.14■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 MYO1BO43795 1136 aa24.14■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 PSMA7O14818 248 aa24.14■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 RAD50Q92878 1312 aa24.14■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 SPDYE4A6NLX3 237 aa24.14■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 AFMP43652 599 aa24.14■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 TBCAO75347 108 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 PRC1O43663 620 aa24.13■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa24.13■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 CYP7A1P22680 504 aa24.13■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 SYCP3Q8IZU3 236 aa24.13■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 SPAG5Q96R06 1193 aa24.13■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.13■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 AK2P54819 239 aa24.13■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 CEP112Q8N8E3 955 aa24.13■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 RTL1A6NKG5 1358 aa24.13■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 TRAF1Q13077 416 aa24.12■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.12■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.12■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.12■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 SYT1P21579 422 aa24.12■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 TESK2Q96S53 571 aa24.12■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.12■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 HSF2BPO75031 334 aa24.11■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 SLU7O95391 586 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.11■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 PLVAPQ9BX97 442 aa24.11■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM75PA6NK02 468 aa24.11■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 TNRQ92752 1358 aa24.11■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 TUBB4BP68371 445 aa24.11■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 FSD2A1L4K1 749 aa24.1■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTS2O95450 1211 aa24.1■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0753Q2KHM9 967 aa24.1■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.1■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 FLT4P35916 1363 aa24.1■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 TSPY3P0CV98 308 aa24.09■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 TSPY8P0CW00 308 aa24.09■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 CALM1P0DP23 149 aa24.09■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 CALM2P0DP24 149 aa24.09■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 CALM3P0DP25 149 aa24.09■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 CHMLP26374 656 aa24.09■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 TNNQ9UQP3 1299 aa24.09■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 FEZ1Q99689 392 aa24.09■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 ZFYVE9O95405 1425 aa24.09■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 BRAPQ7Z569 592 aa24.09■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 DDX12PQ92771 950 aa24.09■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 PLCH2O75038 1416 aa24.09■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 LIG1P18858 919 aa24.08■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 GNAT2P19087 354 aa24.08■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 ATL3Q6DD88 541 aa24.08■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 USP26Q9BXU7 913 aa24.08■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 TSPYL6Q8N831 410 aa24.08■■□□□ 1.45
CCSAP-201ENST00000284617 TACC1O75410 805 aa24.08■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 CALML3P27482 149 aa24.08■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 STAMBPO95630 424 aa24.07■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 KRT83P78385 493 aa24.07■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 UBE4AQ14139 1066 aa24.07■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC174Q6PII3 467 aa24.07■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D5Q92609 795 aa24.07■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 RUFY3Q7L099 469 aa24.07■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 CHRNA2Q15822 529 aa24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms