RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266987.6

TARBP2-201, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TARBP2, Length 1,867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP2-201ENST00000266987 COL4A1P02462 1669 aa26.55■■□□□ 1.84
TARBP2-201ENST00000266987 SPEF2Q9C093 1822 aa26.55■■□□□ 1.84
TARBP2-201ENST00000266987 ARAP2Q8WZ64 1704 aa26.54■■□□□ 1.84
TARBP2-201ENST00000266987 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
TARBP2-201ENST00000266987 SGSM2O43147 1006 aa26.53■■□□□ 1.84
TARBP2-201ENST00000266987 TM4SF1P30408 202 aa26.53■■□□□ 1.84
TARBP2-201ENST00000266987 ZNF827Q17R98 1081 aa26.53■■□□□ 1.84
TARBP2-201ENST00000266987 TICAM2Q86XR7 235 aa26.53■■□□□ 1.84
TARBP2-201ENST00000266987 XAGE2Q96GT9 111 aa26.53■■□□□ 1.84
TARBP2-201ENST00000266987 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
TARBP2-201ENST00000266987 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.53■■□□□ 1.84
TARBP2-201ENST00000266987 IL25Q9H293 177 aa26.53■■□□□ 1.84
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TARBP2-201ENST00000266987 ATP2B3Q16720 1220 aa26.53■■□□□ 1.84
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TARBP2-201ENST00000266987 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
TARBP2-201ENST00000266987 NLRP3Q96P20 1036 aa26.52■■□□□ 1.84
TARBP2-201ENST00000266987 HIP1O00291 1037 aa26.51■■□□□ 1.83
TARBP2-201ENST00000266987 SNRKQ9NRH2 765 aa26.51■■□□□ 1.83
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TARBP2-201ENST00000266987 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
TARBP2-201ENST00000266987 TAF1P21675 1872 aa26.5■■□□□ 1.83
TARBP2-201ENST00000266987 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
TARBP2-201ENST00000266987 CCDC158Q5M9N0 1113 aa26.49■■□□□ 1.83
TARBP2-201ENST00000266987 RUFY2Q8WXA3 655 aa26.49■■□□□ 1.83
TARBP2-201ENST00000266987 LPIN2Q92539 896 aa26.49■■□□□ 1.83
TARBP2-201ENST00000266987 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa26.49■■□□□ 1.83
TARBP2-201ENST00000266987 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
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TARBP2-201ENST00000266987 AKAP11Q9UKA4 1901 aa26.47■■□□□ 1.83
TARBP2-201ENST00000266987 CNBD1Q8NA66 436 aa26.47■■□□□ 1.83
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TARBP2-201ENST00000266987 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
TARBP2-201ENST00000266987 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.47■■□□□ 1.83
TARBP2-201ENST00000266987 IL17RAQ96F46 866 aa26.47■■□□□ 1.83
TARBP2-201ENST00000266987 FSD1Q9BTV5 496 aa26.47■■□□□ 1.83
TARBP2-201ENST00000266987 RAD50Q92878 1312 aa26.46■■□□□ 1.83
TARBP2-201ENST00000266987 KBTBD3Q8NAB2 608 aa26.46■■□□□ 1.83
TARBP2-201ENST00000266987 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
TARBP2-201ENST00000266987 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.45■■□□□ 1.83
TARBP2-201ENST00000266987 ANO2Q9NQ90 1003 aa26.45■■□□□ 1.83
TARBP2-201ENST00000266987 PAG1Q9NWQ8 432 aa26.45■■□□□ 1.83
TARBP2-201ENST00000266987 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa26.45■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 CHRNDQ07001 517 aa26.44■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 GORABQ5T7V8 394 aa26.44■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.44■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 SERPINB2P05120 415 aa26.43■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 BECN1Q14457 450 aa26.43■■□□□ 1.82
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TARBP2-201ENST00000266987 TTC39AQ5SRH9 613 aa26.42■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 SNX21Q969T3 373 aa26.42■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 MED23Q9ULK4 1368 aa26.42■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 CRY2Q49AN0 593 aa26.42■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.42■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.42■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 FAM227BQ96M60 508 aa26.42■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 TBC1D2Q9BYX2 928 aa26.42■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 TAF5LO75529 589 aa26.41■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 SLC5A1P13866 664 aa26.41■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa26.41■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.41■■□□□ 1.82
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TARBP2-201ENST00000266987 A0A0D9SFI3 127 aa26.4■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 CCDC102BQ68D86 513 aa26.4■■□□□ 1.82
TARBP2-201ENST00000266987 NPHP1O15259 732 aa26.39■■□□□ 1.82
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TARBP2-201ENST00000266987 ST5P78524 1137 aa26.38■■□□□ 1.81
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TARBP2-201ENST00000266987 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa26.37■■□□□ 1.81
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TARBP2-201ENST00000266987 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.37■■□□□ 1.81
TARBP2-201ENST00000266987 SNAP23O00161 211 aa26.36■■□□□ 1.81
TARBP2-201ENST00000266987 SLC4A3P48751 1232 aa26.36■■□□□ 1.81
TARBP2-201ENST00000266987 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
TARBP2-201ENST00000266987 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.36■■□□□ 1.81
TARBP2-201ENST00000266987 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
TARBP2-201ENST00000266987 CCDC171Q6TFL3 1326 aa26.35■■□□□ 1.81
TARBP2-201ENST00000266987 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.35■■□□□ 1.81
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