RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-208ENST00000436638 PACSIN3Q9UKS6 424 aa5.56□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 NPIPA1Q9UND3 350 aa5.56□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 KCNK7Q9Y2U2 307 aa5.56□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 DCHS1Q96JQ0 3298 aa5.56□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 A0A087WZY1 265 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 PINLYPA6NC86 204 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 ANKUB1A6NFN9 424 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 TOR1AO14656 332 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 ARHGEF9O43307 516 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 SUV39H1O43463 412 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 APOL3O95236 402 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 TNFRSF6BO95407 300 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 ZNF682O95780 498 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 GP1BBP13224 206 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 CBR1P16152 277 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 NCK1P16333 377 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 GGT1P19440 569 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 SRMP19623 302 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 HNF1AP20823 631 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 FPR2P25090 351 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 DPP4P27487 766 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 RYKP34925 604 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 CPOXP36551 454 aa5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-208ENST00000436638 GAS1P54826 345 aa5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-208ENST00000436638 MAPK11Q15759 364 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 MAPK14Q16539 360 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 HYAL4Q2M3T9 481 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 NDUFAF6Q330K2 333 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 BEX5Q5H9J7 111 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 RAET1LQ5VY80 246 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 C5orf46Q6UWT4 87 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 CLEC9AQ6UXN8 241 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 GFRALQ6UXV0 394 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 APOOLQ6UXV4 268 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 ZNF836Q6ZNA1 936 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 USP43Q70EL4 1123 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-208ENST00000436638 LRRC17Q8N6Y2 441 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 WDSUB1Q8N9V3 476 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 Q8NA96 180 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 SLC37A3Q8NCC5 494 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 OR10H5Q8NGA6 315 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 OR5W2Q8NH69 310 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 RNF138Q8WVD3 245 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 FAR1Q8WVX9 515 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 NR4A3Q92570 626 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 CORO2AQ92828 525 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 ZG16BQ96DA0 208 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 SFXN2Q96NB2 322 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 FOXN4Q96NZ1 517 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 GNRHR2Q96P88 292 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 TAAR6Q96RI8 345 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 SLC6A15Q9H2J7 730 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 RGCCQ9H4X1 137 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 ASF1BQ9NVP2 202 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 KCNE5Q9UJ90 142 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 ENPP5Q9UJA9 477 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 FBXL7Q9UJT9 491 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 FBXL2Q9UKC9 423 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 USP22Q9UPT9 525 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 VDAC3Q9Y277 283 aa5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-208ENST00000436638 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 CDHR4A6H8M9 788 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 CFAP73A6NFT4 308 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 LRRC3CA6NJW4 275 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 CLDN24A6NM45 220 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 HCN1O60741 890 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 GLSO94925 669 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 SERPINA1P01009 418 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 HPNP05981 417 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 C8BP07358 591 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 RFPL3SP0C7P2 107 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 ABOP16442 354 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 BMP7P18075 431 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 MSR1P21757 451 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 TALDO1P37837 337 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 EIF1P41567 113 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 IDH2P48735 452 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 CAPZA1P52907 286 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 MLLT10P55197 1068 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-208ENST00000436638 ZNF117Q03924 483 aa5.54□□□□□ -1.52
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