RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA21	Q7Z572	469 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	MTERF3	Q96E29	417 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL5B	Q96KC2	179 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	FUT8	Q9BYC5	575 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	PLK3	Q9H4B4	646 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	PDLIM1	O00151	329 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE7A	Q13946	482 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA0040	Q15053	153 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ADRM1	Q16186	407 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	FBLN7	Q53RD9	439 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	AAED1	Q7RTV5	226 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	GRINA	Q7Z429	371 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF786	Q8N393	782 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	SVOPL	Q8N434	492 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC63	Q8NA47	563 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM186	Q96B77	213 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	OR7D2	Q96RA2	312 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	DYSF	O75923	2080 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM114	B3SHH9	223 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	C22orf46	C9J442	243 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	STX11	O75558	287 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf47	O95873	294 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00032	P0C843	101 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	LYNX1	P0DP58	116 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	NPR2	P20594	1047 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	PAX7	P23759	505 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	PRPH2	P23942	346 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	CASQ1	P31415	396 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	LIMS1	P48059	325 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBA1B	P68363	451 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBA4A	P68366	448 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35A1	P78382	337 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFA6	Q01524	100 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	NAAA	Q02083	359 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM153C	Q494X1	144 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	LIPM	Q5VYY2	423 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBA1A	Q71U36	451 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX29	Q8N6K0	151 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	IFT81	Q8WYA0	676 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	MOAP1	Q96BY2	351 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	DDIT4L	Q96D03	193 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	SDF2	Q99470	211 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	FMO2	Q99518	471 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TPK1	Q9H3S4	243 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	MKLN1	Q9UL63	735 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	USP22	Q9UPT9	525 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	DUXA	A6NLW8	204 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		9.36	□□□□□ -0.91

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