RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR1F12Q8NHA8 337 aa2.42□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TM4SF19Q96DZ7 209 aa2.42□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ITCHQ96J02 903 aa2.42□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAAR1Q96RJ0 339 aa2.42□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OMDQ99983 421 aa2.42□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRMSQ9H3Y6 488 aa2.42□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF167Q9H6Y7 350 aa2.42□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ELOVL3Q9HB03 270 aa2.42□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAS2R3Q9NYW6 316 aa2.42□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHRNA9Q9UGM1 479 aa2.42□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC25A15Q9Y619 301 aa2.42□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP8B3O60423 1300 aa2.42□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIP1O00291 1037 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UGT1A9O60656 530 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OPN1MWP04001 364 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OPN1MW2P0DN77 364 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OPN1MW3P0DN78 364 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CA8P35219 290 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MDH1P40925 334 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 REG3AQ06141 175 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ENPEPQ07075 957 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1orf61Q13536 156 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MICBQ29980 383 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RFX4Q33E94 735 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CARD16Q5EG05 197 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNIP4Q6PIL6 250 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q6ZN92 141 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LYPD1Q8N2G4 141 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBALD1Q8TB05 177 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MCOLN3Q8TDD5 553 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC58Q96CX6 371 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLMPQ9H6B4 373 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HOXC10Q9NYD6 342 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR10H1Q9Y4A9 318 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SERPINE3A8MV23 424 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANGPTL7O43827 346 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD5LO43866 347 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF286BP0CG31 522 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IMPDH1P20839 514 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCMT1P22061 227 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PKNOX1P55347 436 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HTD2P86397 168 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VGLL4Q14135 290 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SELPLGQ14242 412 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TATDN3Q17R31 274 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C5orf47Q569G3 176 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MARCH8Q5T0T0 291 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BEND3Q5T5X7 828 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR4D5Q8NGN0 318 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR10T2Q8NGX3 314 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR2L8Q8NGY9 312 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NPAS2Q99743 824 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNTTIP1Q9H147 329 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COQ10BQ9H8M1 238 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZFP14Q9HCL3 533 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF835Q9Y2P0 537 aa2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CARMIL3Q8ND23 1372 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C12orf77C9JDV5 145 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PEX7O00628 323 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DRD5P21918 477 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAX7P23759 505 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC26A3P40879 764 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNFRSF17Q02223 184 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ASPHQ12797 758 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYTH1Q15438 398 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC15A2Q16348 729 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR52E8Q6IFG1 317 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AFTPHQ6ULP2 937 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LYPD2Q6UXB3 125 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIR2DL5AQ8N109 375 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPIN2AQ99865 258 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACTR6Q9GZN1 396 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 REEP4Q9H6H4 257 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL26Q9NPH9 171 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEC14L3Q9UDX4 400 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCSK1NQ9UHG2 260 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COPS3Q9UNS2 423 aa2.39□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLAC8L1A1L4L8 177 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RGSL1A5PLK6 1076 aa2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms