RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHRNB3Q05901 458 aa22.9■■□□□ 1.26
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CREB3L2Q70SY1 520 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR10H5Q8NGA6 315 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HTRA1Q92743 480 aa22.9■■□□□ 1.26
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.88■■□□□ 1.25
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A36Q96CQ1 311 aa22.88■■□□□ 1.25
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBRG1Q3YBR2 411 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPHX4Q8IUS5 362 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF525Q8N782 197 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR1K1Q8NGR3 316 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FTCDNL1E5RQL4 147 aa22.86■■□□□ 1.25
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A16P16260 332 aa22.85■■□□□ 1.25
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIPK1Q86Z02 1210 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KDM8Q8N371 416 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM168AQ92567 244 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C7orf26Q96N11 449 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC38A2Q96QD8 506 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNS3Q9BQ31 491 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTDSS2Q9BVG9 487 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MXRA5Q9NR99 2828 aa22.85■■□□□ 1.25
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO17Q96EF6 278 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00470Q9BZP3 86 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C12orf10Q9HB07 376 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF43P17038 809 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLDN17P56750 224 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRIF1Q5T3J3 769 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GCNT6Q5T4J0 391 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HMBOX1Q6NT76 420 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C6orf89Q6UWU4 347 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FUNDC1Q8IVP5 155 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NFKBIDQ8NI38 313 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RCE1Q9Y256 329 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NR5A2O00482 541 aa22.82■■□□□ 1.24
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