RNA–Protein interactions for RNA: YNL207W

RIO2, Essential serine kinase involved in the processing of 20S pre-rRNA, yeast

Gene RIO2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIO2	YNL207W	SPC29	P33419	253 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	OAR1	P35731	278 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	SUL1	P38359	859 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	VHR1	P40522	640 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	OSW7	P43611	510 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	PUS2	P53167	370 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	DAM1	P53267	343 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	MET7	Q08645	548 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	SWM1	Q12379	170 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	RPP1	P38786	293 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	RNT1	Q02555	471 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	ASM4	Q05166	528 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	PRC1	P00729	532 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.84	□□□□□ -1.79	not detected
RIO2	YNL207W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	ALG7	P07286	448 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	GDH3	P39708	457 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	PFA3	P42836	336 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	SSY5	P47002	699 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	RPN4	Q03465	531 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	REH1	Q06709	432 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RIO2	YNL207W	YBR053C	P38235	358 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	SAK1	P38990	1142 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	ELO3	P40319	345 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	BUD6	P41697	788 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	FKH2	P41813	862 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	UBA2	P52488	636 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	MUK1	Q02866	612 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	YDR338C	Q05497	695 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	OMS1	Q06668	471 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	FRE5	Q08908	694 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	YTA7	P40340	1379 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	YLR415C	O13578	112 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	PER1	P25625	357 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	TIM23	P32897	222 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.82	□□□□□ -1.8	not detected
RIO2	YNL207W	SIC1	P38634	284 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	MUP1	P50276	574 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	DLT1	Q04216	342 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	YDR514C	Q04408	483 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	TMN2	Q04562	672 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	MET3	P08536	511 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	PZF1	P39933	429 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	STB4	P50104	949 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	ZIP2	P53061	704 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	PKH1	Q03407	766 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	ADY4	Q05955	493 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	RSC3	Q06639	885 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	MTC2	P34246	357 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	SAP190	P36123	1033 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	PPS1	P38148	807 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	ATF1	P40353	525 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	YMR206W	Q03695	313 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	TGL5	Q12043	749 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	MCD4	P36051	919 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	NRG1	Q03125	231 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	MCH5	Q08777	521 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	MDM12	Q92328	271 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	DIF1	O13577	133 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	MIH1	P23748	554 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	MEF1	P25039	761 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	NUP82	P40368	713 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	YJL163C	P46996	555 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	ALY2	P47029	1046 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	ACF2	Q12168	779 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RIO2	YNL207W	CDC9	P04819	755 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	NGG1	P32494	702 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	HOS4	P40480	1083 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	SHR5	P41912	237 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	IRC13	Q08630	104 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	YLR149C	Q99296	730 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	CIT2	P08679	460 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	MTH1	P35198	433 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	YIR042C	P40586	236 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	BAP3	P41815	604 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	AMA1	P50082	593 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	GND2	P53319	492 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	PPG1	P32838	368 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	YHL017W	P38745	532 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	BCD1	P38772	366 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	SDS3	P40505	327 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	CAF16	P43569	289 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	CRR1	Q05790	422 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	IRC10	Q08118	586 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RIO2	YNL207W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		3.75	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.2 ms