RNA–Protein interactions for RNA: YMR112C

MED11, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene MED11, Length 396 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MED11	YMR112C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
MED11	YMR112C	GTS1	P40956	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	UBX4	P54730	416 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	VPS72	Q03388	795 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	RSM24	Q03976	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	MPD2	Q99316	277 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	PRC1	P00729	532 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	PIF1	P07271	859 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	KAR1	P11927	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	CHS2	P14180	963 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	APL1	P27351	700 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	HSP78	P33416	811 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	SAP190	P36123	1033 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	YKR051W	P36142	418 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	MAL31	P38156	614 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	BIT2	P38346	545 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	HXT7	P39004	570 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	CEP3	P40969	608 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	PIP2	P52960	996 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	NPY1	P53164	384 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	PUS2	P53167	370 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	YGR012W	P53206	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	MET14	Q02196	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	PHM6	Q05637	104 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	YPL277C	Q08989	487 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	HFI1	Q12060	488 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	FBP1	P09201	348 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	ATG19	P35193	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	IES5	P40060	125 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	YFL052W	P43551	465 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	ZIP2	P53061	704 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	PCL10	P53124	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	ORC3	P54790	616 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	SKY1	Q03656	742 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	SSY1	Q03770	852 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	ATG16	Q03818	150 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	MLC2	Q06580	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	PEX15	Q08215	383 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	ADP1	P25371	1049 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	PTP2	P29461	750 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	NIC96	P34077	839 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	MAC1	P35192	417 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	OAF3	P36023	863 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	DCS2	Q12123	353 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MED11	YMR112C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	SPE1	P08432	466 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	DAL3	P32459	195 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	YKL133C	P36066	463 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	KAE1	P36132	386 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	FLR1	P38124	548 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	CTF8	P38877	133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	ZRG8	P40021	1076 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	MND2	P40577	368 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	SLD3	P53135	668 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	YGR021W	P53212	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	YHM2	Q04013	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	CRR1	Q05790	422 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	GAL1	P04385	528 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	SWI6	P09959	803 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	RPD3	P32561	433 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	POA1	P38218	177 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	RIM4	P38741	713 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	SPC105	P53148	917 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	YDL121C	Q07541	149 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	KCC4	P25389	1037 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	PTH2	P34222	208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	SDP1	P40479	209 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED11	YMR112C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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