RNA–Protein interactions for RNA: YJL096W

MRPL49, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL49, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL49	YJL096W	ASI2	P53895	289 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	LCD1	Q04377	747 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	CDC43	P18898	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	VHR1	P40522	640 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
MRPL49	YJL096W	HUL5	P53119	910 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	PUS2	P53167	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	RIA1	P53893	1110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	RPN4	Q03465	531 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	YJR142W	P47173	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	AMA1	P50082	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	PKH1	Q03407	766 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	COQ11	Q05892	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	REC104	P33323	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	IRR1	P40541	1150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	AFT2	Q08957	416 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	MDM10	P18409	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	KIN3	P22209	435 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	GRX4	P32642	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	FLO10	P36170	1169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	MNN1	P39106	762 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	HOF1	Q05080	669 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
MRPL49	YJL096W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	TIM23	P32897	222 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	NUP82	P40368	713 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	IRC13	Q08630	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL49	YJL096W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	RAD4	P14736	754 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	NGG1	P32494	702 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	YIL166C	P40445	542 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	YIR042C	P40586	236 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	OSW7	P43611	510 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	NRG1	Q03125	231 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	STE5	P32917	917 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	ARO10	Q06408	635 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	PZF1	P39933	429 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	YEN1	P40028	759 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	TIM54	P47045	478 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	SGO1	Q08490	590 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	ADY2	P25613	283 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	CDC11	P32458	415 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	PFD1	P46988	109 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	ENV7	Q12003	364 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	YLR415C	O13578	112 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	DMC1	P25453	334 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	SCT1	P32784	759 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	YJL049W	P47048	450 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	DNM1	P54861	757 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	SSL2	Q00578	843 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	YBR284W	P38150	797 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	BCD1	P38772	366 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	SAK1	P38990	1142 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	UBP12	P39538	1254 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	FMP52	P40008	231 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	PFA3	P42836	336 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	ALR2	P43553	858 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	TEL2	P53038	688 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	YAP7	Q08182	245 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	ICT1	Q12385	394 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL49	YJL096W	PHO8	P11491	566 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL49	YJL096W	YBR184W	P38299	523 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL49	YJL096W	SSY5	P47002	699 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL49	YJL096W	DAM1	P53267	343 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL49	YJL096W	THI7	Q05998	598 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL49	YJL096W	TGL5	Q12043	749 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL49	YJL096W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65

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