RNA–Protein interactions for RNA: YGR136W

LSB1, Transcript of Negative regulator of actin nucleation-promoting factor activity, yeast

Gene LSB1, Length 726 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LSB1	YGR136W	RIM20	Q12033	661 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	RKM4	Q12504	494 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	PIF1	P07271	859 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	PHO8	P11491	566 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	ADD66	P36040	267 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	YKL069W	P36088	180 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	YIL089W	P40500	205 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	YIR042C	P40586	236 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	EST2	Q06163	884 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	MDL2	P33311	773 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	TFA2	P36145	328 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	SPO22	P40511	975 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	GCV1	P48015	400 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	FMP25	Q08023	583 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	ELG1	Q12050	791 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	CIT1	P00890	479 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	MSP1	P28737	362 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	SPC110	P32380	944 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	MKK2	P32491	506 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	ATG14	P38270	344 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	YBR184W	P38299	523 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	PNT1	P38969	423 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	MNN1	P39106	762 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	DJP1	P40564	432 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	CNN1	P43618	361 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	SMC3	P47037	1230 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	HNT2	P49775	206 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	MTC3	P53077	123 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	GIS1	Q03833	894 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	COG8	Q04632	607 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	FLO11	P08640	1367 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	OPI1	P21957	404 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	STE5	P32917	917 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	VBA5	P36172	582 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	HUL4	P40985	892 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	TAF1	P46677	1066 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	TPO2	P53283	614 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	ROD1	Q02805	837 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	VPS20	Q04272	221 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LSB1	YGR136W	CYB2	P00175	591 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	BIK1	P11709	440 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	INO1	P11986	533 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	TIM23	P32897	222 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	YKL107W	P34251	309 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	RGD1	P38339	666 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	NEM1	P38757	446 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	BDH2	P39713	417 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	RAD26	P40352	1085 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	NEO1	P40527	1151 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	NPA3	P47122	385 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	PIP2	P52960	996 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	HST1	P53685	503 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	EAF1	Q06337	982 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	LAP2	Q10740	671 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	CAN1	P04817	590 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	SNF3	P10870	884 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	THI4	P32318	326 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	GRX7	P38068	203 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	HSE1	P38753	452 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	GIP4	P39732	760 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LSB1	YGR136W	PFD1	P46988	109 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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