RNA–Protein interactions for RNA: Q0160

SCEI, Transcript of I-SceI DNA endonuclease, yeast

Gene SCEI, Length 708 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCEI	Q0160	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SCEI	Q0160	TAF3	Q12297	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCEI	Q0160	SPO11	P23179	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCEI	Q0160	REC104	P33323	182 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCEI	Q0160	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCEI	Q0160	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCEI	Q0160	YLR415C	O13578	112 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	BCD1	P38772	366 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	YJL206C	P39529	758 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	PZF1	P39933	429 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	CWC24	P53769	259 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	ASM4	Q05166	528 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	HAL9	Q12180	1030 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	EMP70	P32802	667 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	HOS4	P40480	1083 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	UBC11	P52492	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	PIN2	Q12057	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	SAK1	P38990	1142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	IRR1	P40541	1150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	TGL5	Q12043	749 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	RPN13	O13563	156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	PRI2	P20457	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	ORC2	P32833	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	YEL020C	P39994	560 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	PFA3	P42836	336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	YAP1802	P53309	568 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	SIC1	P38634	284 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	SSY5	P47002	699 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	ATG11	Q12527	1178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	HIR1	P32479	840 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	NDC80	P40460	691 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	MAD1	P40957	749 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCEI	Q0160	SCT1	P32784	759 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	BAP3	P41815	604 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	ENV7	Q12003	364 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	YOR022C	Q12204	715 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	STE5	P32917	917 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	YPR071W	Q12346	211 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	SIR3	P06701	978 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	CDC11	P32458	415 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	GAT1	P43574	510 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	RIM13	Q03792	727 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	SCS3	P53012	380 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	SEG1	Q04279	960 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	GPR1	Q12361	961 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	REV7	P38927	245 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	BDH2	P39713	417 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	PFD1	P46988	109 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	RSC3	Q06639	885 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	PRC1	P00729	532 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	DAL7	P21826	554 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	VPS34	P22543	875 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	GLG1	P36143	616 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	YBR284W	P38150	797 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	UBS1	P38290	277 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	PAC2	P39937	518 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	ARG2	P40360	574 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	NIT3	P49954	291 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SCEI	Q0160	PET10	P36139	283 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	YBR259W	P38338	688 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	CTR1	P49573	406 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	THI21	Q08975	551 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	TOP3	P13099	656 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	YUR1	P26725	428 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	OSW1	Q08692	278 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	YBR184W	P38299	523 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	ALR2	P43553	858 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	TAD1	P53065	400 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	GAD1	Q04792	585 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	YCL002C	P25565	263 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	ECM1	P39715	212 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	MRK1	P50873	501 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	SAP190	P36123	1033 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	LTP1	P40347	161 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	FMP25	Q08023	583 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	EMC3	P36039	253 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SCEI	Q0160	ATG4	P53867	494 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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