RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 CHMLP26374 656 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 NEO1Q92859 1461 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 STX8Q9UNK0 236 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 WTAPQ15007 396 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 KAT14Q9H8E8 782 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 BTG4Q9NY30 223 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBTB43O43298 467 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 Q6ZUG5 572 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 RAB34Q9BZG1 259 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF165P49910 485 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-208ENST00000615445 HOXB7P09629 217 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 UQCRHLA0A096LP55 91 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 UQCRHP07919 91 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC181Q5TID7 509 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT23Q9C075 422 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 ST5P78524 1137 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 ESR2Q92731 530 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 WWC2Q6AWC2 1192 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 USP26Q9BXU7 913 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 MYO6Q9UM54 1294 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 AK2P54819 239 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM89AQ96GI7 184 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 USP19O94966 1318 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 ALG1Q9BT22 464 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 TMTC2Q8N394 836 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 TIMM10P62072 90 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 STX1AQ16623 288 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 PRC1O43663 620 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 PTPN14Q15678 1187 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC102BQ68D86 513 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 ISM2Q6H9L7 571 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 CHST3Q7LGC8 479 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA1328Q86T90 577 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 INSRP06213 1382 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 UBA7P41226 1012 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 SETQ01105 290 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 SKIDA1Q1XH10 827 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 USP48Q86UV5 1035 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCA8O94911 1581 aa23.89■■□□□ 1.42
PTPRJ-208ENST00000615445 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 HLA-DOAP06340 250 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 GSTO1P78417 241 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 ADCY5O95622 1261 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 RTN1Q16799 776 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 F13A1P00488 732 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 RDXP35241 583 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 TNIP1Q15025 636 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 CUL5Q93034 780 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms