RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		11.4	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	GREM2	Q9H772	168 aa		11.4	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		11.4	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZBTB7A	O95365	584 aa		11.39	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	DCTPP1	Q9H773	170 aa		11.39	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMC5	Q8IY18	1101 aa		11.39	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		11.39	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	ST5	P78524	1137 aa		11.39	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	NLRP3	Q96P20	1036 aa		11.39	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		11.38	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYH3	P11055	1940 aa		11.38	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	ITGA6	P23229	1130 aa		11.38	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	APBB1	O00213	710 aa		11.37	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		11.37	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	GCC1	Q96CN9	775 aa		11.37	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	SIL1	Q9H173	461 aa		11.37	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	MTFR1L	Q9H019	292 aa		11.37	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	COPRS	Q9NQ92	184 aa		11.37	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		11.37	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	LAMB2	P55268	1798 aa		11.36	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	CASZ1	Q86V15	1759 aa		11.36	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		11.36	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		11.36	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		11.36	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		11.36	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	BCL11A	Q9H165	835 aa		11.36	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		11.35	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	SKAP1	Q86WV1	359 aa		11.35	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	RTL9	Q8NET4	1388 aa		11.35	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		11.35	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.34	□□□□□ -0.59	8e-7	■■■□□ 17.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CRY2	Q49AN0	593 aa		11.34	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		11.34	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	NUCB1	Q02818	461 aa		11.34	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC24	Q50LG9	513 aa		11.34	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		11.34	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	LNPK	Q9C0E8	428 aa		11.34	□□□□□ -0.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		11.33	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		11.33	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	EYA2	O00167	538 aa		11.33	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAB11FIP3	O75154	756 aa		11.33	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	SASH1	O94885	1247 aa		11.33	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		11.33	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		11.33	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		11.33	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	POLD1	P28340	1107 aa		11.33	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		11.33	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	COL4A1	P02462	1669 aa		11.32	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		11.32	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDE6B	P35913	854 aa		11.32	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		11.32	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		11.32	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		11.32	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	TAF1	P21675	1872 aa		11.32	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	CIAO1	O76071	339 aa		11.32	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		11.32	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		11.32	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	SRGN	P10124	158 aa		11.31	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		11.31	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		11.31	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTGER2	P43116	358 aa		11.31	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.31	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	TFCP2	Q12800	502 aa		11.31	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		11.3	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	GRAP	Q13588	217 aa		11.3	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		11.3	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	SOCS7	O14512	581 aa		11.3	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDE4A	P27815	886 aa		11.3	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHRNA5	P30532	468 aa		11.3	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	RGS3	P49796	1198 aa		11.3	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRP5	O75197	1615 aa		11.29	□□□□□ -0.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms