RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 SNX21Q969T3 373 aa34.68■■■■□ 3.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 CIAO1O76071 339 aa34.67■■■■□ 3.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM89AQ96GI7 184 aa34.67■■■■□ 3.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 SOCS7O14512 581 aa34.67■■■■□ 3.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 TNNI3KQ59H18 835 aa34.67■■■■□ 3.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATG9AQ7Z3C6 839 aa34.67■■■■□ 3.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 GPR108Q9NPR9 543 aa34.67■■■■□ 3.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa34.67■■■■□ 3.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 TFCP2Q12800 502 aa34.66■■■■□ 3.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHMP3Q9Y3E7 222 aa34.66■■■■□ 3.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 IL15P40933 162 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 CAMTA2O94983 1202 aa34.64■■■■□ 3.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 GPTP24298 496 aa34.64■■■■□ 3.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa34.64■■■■□ 3.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 EYA2O00167 538 aa34.64■■■■□ 3.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 UBN2Q6ZU65 1347 aa34.62■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 RGL2O15211 777 aa34.62■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 AK7Q96M32 723 aa34.62■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 EVI5LQ96CN4 794 aa34.61■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 TAF1LQ8IZX4 1826 aa34.61■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 MYH3P11055 1940 aa34.61■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC57Q2TAC2 916 aa34.61■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 BCORQ6W2J9 1755 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 C4BP0C0L5 1744 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 PARP10Q53GL7 1025 aa34.58■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 GNPATO15228 680 aa34.58■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP5JP18859 108 aa34.58■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF827Q17R98 1081 aa34.58■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 TTLL11Q8NHH1 800 aa34.58■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 AKT1S1Q96B36 256 aa34.58■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 STK32BQ9NY57 414 aa34.57■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 PDE8AO60658 829 aa34.56■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 CTSWP56202 376 aa34.56■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 RABEP1Q15276 862 aa34.56■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 CLEC4GQ6UXB4 293 aa34.56■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 SYNE4Q8N205 404 aa34.56■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 SGSM2O43147 1006 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 HSCBQ8IWL3 235 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 IL17RAQ96F46 866 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRRC24Q50LG9 513 aa34.54■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC15A2Q16348 729 aa34.53■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 RPS6KA4O75676 772 aa34.52■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF652Q9Y2D9 606 aa34.52■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 HIP1O00291 1037 aa34.52■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 SUSD4Q5VX71 490 aa34.52■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF609O15014 1411 aa34.51■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 RUFY2Q8WXA3 655 aa34.51■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 DBNDD2Q9BQY9 259 aa34.51■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 SH3TC1Q8TE82 1336 aa34.51■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 PHF14O94880 888 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANAPC15P60006 121 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 IL25Q9H293 177 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 BOLA2Q9H3K6 86 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANO2Q9NQ90 1003 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 SMIM5Q71RC9 77 aa34.49■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 AMIGO3Q86WK7 504 aa34.49■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 CEP126Q9P2H0 1117 aa34.49■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 MCCP23508 829 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 GREM2Q9H772 168 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 LAMB2P55268 1798 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 ITGA6P23229 1130 aa34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANTXR1Q9H6X2 564 aa34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 SCN7AQ01118 1682 aa34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 RFX7Q2KHR2 1363 aa34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 TICAM2Q86XR7 235 aa34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 SNRKQ9NRH2 765 aa34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 AKAP2Q9Y2D5 859 aa34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 NTSR2O95665 410 aa34.46■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 SSFA2P28290 1259 aa34.46■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 HAUS7Q99871 368 aa34.46■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP34.46■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa34.46■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 TAF7LQ5H9L4 462 aa34.45■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRP5O75197 1615 aa34.45■■■■□ 3.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRAPPC3LQ5T215 181 aa34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 IL27Q8NEV9 243 aa34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAD50Q92878 1312 aa34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADRA2BP18089 450 aa34.43■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81 ms