RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa30.84■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 IGKV5-2P06315 115 aa30.83■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 TIAM2Q8IVF5 1701 aa30.83■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 PRELPP51888 382 aa30.82■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 ALDH1L2Q3SY69 923 aa30.8■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 PTPRCP08575 1304 aa30.79■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 KIF3CO14782 793 aa30.79■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 TOMM70O94826 608 aa30.79■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 GCKRQ14397 625 aa30.79■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 MPNDQ8N594 471 aa30.79■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 OLFM4Q6UX06 510 aa30.78■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 SNED1Q8TER0 1413 aa30.78■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 H7C1W4 665 aa30.77■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 RPS8P62241 208 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
PITX3-202ENST00000539804 CTSWP56202 376 aa30.76■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 NMRK2Q9NPI5 230 aa30.76■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 EIF6P56537 245 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 LARGE2Q8N3Y3 721 aa30.75■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 PLA2G12BQ9BX93 195 aa30.75■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 RRAGCQ9HB90 399 aa30.75■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 IQCA1LA6NCM1 817 aa30.74■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 ALDH1L1O75891 902 aa30.74■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa30.74■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa30.73■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 NIM1KQ8IY84 436 aa30.73■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.73■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 RTL9Q8NET4 1388 aa30.72■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 FZD9O00144 591 aa30.72■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 PPIP5K2O43314 1243 aa30.72■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 BEND3Q5T5X7 828 aa30.72■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 EYA3Q99504 573 aa30.71■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa30.71■■■□□ 2.51
PITX3-202ENST00000539804 WDR90Q96KV7 1748 aa30.7■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 F6X3S4 739 aa30.69■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 FSTL1Q12841 308 aa30.69■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 SLC4A10Q6U841 1118 aa30.69■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 GPC2Q8N158 579 aa30.69■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 TTLL11Q8NHH1 800 aa30.69■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 SSH1Q8WYL5 1049 aa30.68■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 SMC4Q9NTJ3 1288 aa30.68■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 LRRC37AA6NMS7 1700 aa30.67■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 MYH3P11055 1940 aa30.67■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.67■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 KIAA2012Q0VF49 1180 aa30.67■■■□□ 2.5
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PITX3-202ENST00000539804 PODXL2Q9NZ53 605 aa30.66■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 DDNO94850 711 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 SMC1BQ8NDV3 1235 aa30.65■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 SEC31BQ9NQW1 1179 aa30.65■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa30.65■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 CASP7P55210 303 aa30.64■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 AOC3Q16853 763 aa30.64■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 WASHC4Q2M389 1173 aa30.64■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 ZNRF3Q9ULT6 936 aa30.64■■■□□ 2.5
PITX3-202ENST00000539804 C6orf229H3BNL8 230 aa30.63■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 CSF1RP07333 972 aa30.62■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 GREM2Q9H772 168 aa30.62■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 GGA1Q9UJY5 639 aa30.62■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 MPHOSPH8Q99549 860 aa30.61■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 XDHP47989 1333 aa30.61■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 SCN4AP35499 1836 aa30.61■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa30.6■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 GPSM2P81274 684 aa30.6■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 TNIP1Q15025 636 aa30.6■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 KIF16BQ96L93 1317 aa30.6■■■□□ 2.49
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PITX3-202ENST00000539804 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 ZNF541Q9H0D2 1346 aa30.6■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 HACL1Q9UJ83 578 aa30.6■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 TAF1P21675 1872 aa30.59■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 ITGA6P23229 1130 aa30.59■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 HSPA6P17066 643 aa30.58■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 ATP2B4P23634 1241 aa30.58■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 HDAC5Q9UQL6 1122 aa30.58■■■□□ 2.49
PITX3-202ENST00000539804 G3V3G9 751 aa30.57■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 DCAF8Q5TAQ9 597 aa30.57■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 TBC1D16Q8TBP0 767 aa30.57■■■□□ 2.48
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