RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-221	ENST00000511747	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		32.14	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		32.14	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	JCAD	Q9P266	1359 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	ATP5J	P18859	108 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	MAP3K11	Q16584	847 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	TNNI3K	Q59H18	835 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	TFCP2	Q12800	502 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	KRT32	Q14532	448 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	SPATA32	Q96LK8	384 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	DACT1	Q9NYF0	836 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	COL15A1	P39059	1388 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	USP16	Q9Y5T5	823 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	TYRO3	Q06418	890 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	NEK1	Q96PY6	1258 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	MRC1	P22897	1456 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SH3BP2-221	ENST00000511747	PHKG2	P15735	406 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	SPC24	Q8NBT2	197 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	TNMD	Q9H2S6	317 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	CHGB	P05060	677 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	GTF3C6	Q969F1	213 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	JAK2	O60674	1132 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	TPM3	P06753	285 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	LUZP1	Q86V48	1076 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747		Q6ZUG5	572 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	CYP21A2	P08686	494 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		32.01	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		32.01	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		32.01	■■■□□ 2.72
SH3BP2-221	ENST00000511747		A0A087WZG4	1122 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	BRF1	Q92994	677 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	PGBD1	Q96JS3	809 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	HAUS7	Q99871	368 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	ZMYND15	Q9H091	742 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	ZNF609	O15014	1411 aa		32	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	NR1I2	O75469	434 aa		32	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	DDX11	Q96FC9	970 aa		32	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	CBX8	Q9HC52	389 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	31.99	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	C5	P01031	1676 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	31.98	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747		H3BQV1	296 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	REST	Q13127	1097 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	IFFO2	Q5TF58	517 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	BICD2	Q8TD16	824 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SH3BP2-221	ENST00000511747	RGPD5	Q99666	1765 aa		31.96	■■■□□ 2.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms