RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468380.1

LINC00888-201, long intergenic non-protein coding RNA 888, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00888, Length 1,241 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00888-201ENST00000468380 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
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LINC00888-201ENST00000468380 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.73■■□□□ 1.55
LINC00888-201ENST00000468380 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
LINC00888-201ENST00000468380 YDJCA8MPS7 323 aa24.72■■□□□ 1.55
LINC00888-201ENST00000468380 BBOX1O75936 387 aa24.72■■□□□ 1.55
LINC00888-201ENST00000468380 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.72■■□□□ 1.55
LINC00888-201ENST00000468380 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
LINC00888-201ENST00000468380 MPNDQ8N594 471 aa24.72■■□□□ 1.55
LINC00888-201ENST00000468380 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.72■■□□□ 1.55
LINC00888-201ENST00000468380 DGKZQ13574 1117 aa24.71■■□□□ 1.55
LINC00888-201ENST00000468380 PROSER3Q2NL68 480 aa24.71■■□□□ 1.55
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LINC00888-201ENST00000468380 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.71■■□□□ 1.55
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LINC00888-201ENST00000468380 ANXA1P04083 346 aa24.7■■□□□ 1.54
LINC00888-201ENST00000468380 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
LINC00888-201ENST00000468380 USP48Q86UV5 1035 aa24.7■■□□□ 1.54
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LINC00888-201ENST00000468380 NFE2L2Q16236 605 aa24.69■■□□□ 1.54
LINC00888-201ENST00000468380 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.68■■□□□ 1.54
LINC00888-201ENST00000468380 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
LINC00888-201ENST00000468380 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
LINC00888-201ENST00000468380 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
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LINC00888-201ENST00000468380 NOGQ13253 232 aa24.66■■□□□ 1.54
LINC00888-201ENST00000468380 NLRP10Q86W26 655 aa24.66■■□□□ 1.54
LINC00888-201ENST00000468380 MICALL2Q8IY33 904 aa24.66■■□□□ 1.54
LINC00888-201ENST00000468380 NEFMP07197 916 aa24.65■■□□□ 1.54
LINC00888-201ENST00000468380 SAMD7Q7Z3H4 446 aa24.65■■□□□ 1.54
LINC00888-201ENST00000468380 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
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LINC00888-201ENST00000468380 GRAPQ13588 217 aa24.64■■□□□ 1.54
LINC00888-201ENST00000468380 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
LINC00888-201ENST00000468380 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
LINC00888-201ENST00000468380 TAF1P21675 1872 aa24.64■■□□□ 1.53
LINC00888-201ENST00000468380 LAMB2P55268 1798 aa24.63■■□□□ 1.53
LINC00888-201ENST00000468380 EGFRP00533 1210 aa24.63■■□□□ 1.53
LINC00888-201ENST00000468380 COPS6Q7L5N1 327 aa24.63■■□□□ 1.53
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF428Q96B54 188 aa24.63■■□□□ 1.53
LINC00888-201ENST00000468380 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.63■■□□□ 1.53
LINC00888-201ENST00000468380 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.62■■□□□ 1.53
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LINC00888-201ENST00000468380 PSMD14O00487 310 aa24.61■■□□□ 1.53
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LINC00888-201ENST00000468380 TCIRG1Q13488 830 aa24.61■■□□□ 1.53
LINC00888-201ENST00000468380 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.61■■□□□ 1.53
LINC00888-201ENST00000468380 DPF2Q92785 391 aa24.61■■□□□ 1.53
LINC00888-201ENST00000468380 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.61■■□□□ 1.53
LINC00888-201ENST00000468380 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.61■■□□□ 1.53
LINC00888-201ENST00000468380 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
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LINC00888-201ENST00000468380 NECTIN2Q92692 538 aa24.6■■□□□ 1.53
LINC00888-201ENST00000468380 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.6■■□□□ 1.53
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LINC00888-201ENST00000468380 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.59■■□□□ 1.53
LINC00888-201ENST00000468380 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.59■■□□□ 1.53
LINC00888-201ENST00000468380 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
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LINC00888-201ENST00000468380 RNF186Q9NXI6 227 aa24.57■■□□□ 1.52
LINC00888-201ENST00000468380 POLLQ9UGP5 575 aa24.57■■□□□ 1.52
LINC00888-201ENST00000468380 RIMBP2O15034 1052 aa24.56■■□□□ 1.52
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LINC00888-201ENST00000468380 TMC4Q7Z404 712 aa24.55■■□□□ 1.52
LINC00888-201ENST00000468380 C2orf69Q8N8R5 385 aa24.55■■□□□ 1.52
LINC00888-201ENST00000468380 CCDC102AQ96A19 550 aa24.55■■□□□ 1.52
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LINC00888-201ENST00000468380 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
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LINC00888-201ENST00000468380 GPSM2P81274 684 aa24.54■■□□□ 1.52
LINC00888-201ENST00000468380 DOK7Q18PE1 504 aa24.54■■□□□ 1.52
LINC00888-201ENST00000468380 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.54■■□□□ 1.52
LINC00888-201ENST00000468380 RIPK4P57078 832 aa24.53■■□□□ 1.52
LINC00888-201ENST00000468380 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
LINC00888-201ENST00000468380 CSRNP1Q96S65 589 aa24.53■■□□□ 1.52
LINC00888-201ENST00000468380 COL4A1P02462 1669 aa24.53■■□□□ 1.52
LINC00888-201ENST00000468380 C6orf229H3BNL8 230 aa24.52■■□□□ 1.52
LINC00888-201ENST00000468380 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
LINC00888-201ENST00000468380 KRT24Q2M2I5 525 aa24.52■■□□□ 1.52
LINC00888-201ENST00000468380 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.52■■□□□ 1.52
LINC00888-201ENST00000468380 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
LINC00888-201ENST00000468380 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.52■■□□□ 1.52
LINC00888-201ENST00000468380 ECE2O60344 883 aa24.51■■□□□ 1.51
LINC00888-201ENST00000468380 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
LINC00888-201ENST00000468380 FAM89AQ96GI7 184 aa24.51■■□□□ 1.51
LINC00888-201ENST00000468380 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
LINC00888-201ENST00000468380 SLC10A3P09131 477 aa24.49■■□□□ 1.51
LINC00888-201ENST00000468380 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.49■■□□□ 1.51
LINC00888-201ENST00000468380 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.48■■□□□ 1.51
LINC00888-201ENST00000468380 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.48■■□□□ 1.51
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