RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
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NME4-209ENST00000460297 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
NME4-209ENST00000460297 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
NME4-209ENST00000460297 ILDR2Q71H61 639 aa30.08■■■□□ 2.41
NME4-209ENST00000460297 COPRSQ9NQ92 184 aa30.08■■■□□ 2.41
NME4-209ENST00000460297 SERPINB2P05120 415 aa30.07■■■□□ 2.41
NME4-209ENST00000460297 CCDC24Q8N4L8 307 aa30.07■■■□□ 2.41
NME4-209ENST00000460297 GREM2Q9H772 168 aa30.07■■■□□ 2.41
NME4-209ENST00000460297 MSL1Q68DK7 614 aa30.07■■■□□ 2.4
NME4-209ENST00000460297 CHD1LQ86WJ1 897 aa30.07■■■□□ 2.4
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NME4-209ENST00000460297 C3orf67Q6ZVT6 689 aa30.06■■■□□ 2.4
NME4-209ENST00000460297 CNBD1Q8NA66 436 aa30.06■■■□□ 2.4
NME4-209ENST00000460297 LNPKQ9C0E8 428 aa30.05■■■□□ 2.4
NME4-209ENST00000460297 NRXN2Q9P2S2 1712 aa30.05■■■□□ 2.4
NME4-209ENST00000460297 CCDC57Q2TAC2 916 aa30.04■■■□□ 2.4
NME4-209ENST00000460297 SIL1Q9H173 461 aa30.04■■■□□ 2.4
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NME4-209ENST00000460297 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
NME4-209ENST00000460297 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
NME4-209ENST00000460297 RAB11FIP3O75154 756 aa30.03■■■□□ 2.4
NME4-209ENST00000460297 ITGA6P23229 1130 aa30.03■■■□□ 2.4
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NME4-209ENST00000460297 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa30.03■■■□□ 2.4
NME4-209ENST00000460297 MMP10P09238 476 aa30.02■■■□□ 2.4
NME4-209ENST00000460297 PDE4AP27815 886 aa30.02■■■□□ 2.4
NME4-209ENST00000460297 LRRCC1Q9C099 1032 aa30.02■■■□□ 2.4
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NME4-209ENST00000460297 RTL9Q8NET4 1388 aa30.01■■■□□ 2.39
NME4-209ENST00000460297 RIC1Q4ADV7 1423 aa30■■■□□ 2.39
NME4-209ENST00000460297 RGS3P49796 1198 aa30■■■□□ 2.39
NME4-209ENST00000460297 NLRP3Q96P20 1036 aa30■■■□□ 2.39
NME4-209ENST00000460297 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa29.99■■■□□ 2.39
NME4-209ENST00000460297 SASH1O94885 1247 aa29.99■■■□□ 2.39
NME4-209ENST00000460297 KIF1BPQ96EK5 621 aa29.99■■■□□ 2.39
NME4-209ENST00000460297 SEC31BQ9NQW1 1179 aa29.98■■■□□ 2.39
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NME4-209ENST00000460297 ST5P78524 1137 aa29.98■■■□□ 2.39
NME4-209ENST00000460297 ATG9AQ7Z3C6 839 aa29.98■■■□□ 2.39
NME4-209ENST00000460297 BCL11AQ9H165 835 aa29.98■■■□□ 2.39
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NME4-209ENST00000460297 COL4A1P02462 1669 aa29.97■■■□□ 2.39
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NME4-209ENST00000460297 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
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NME4-209ENST00000460297 IL15P40933 162 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
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NME4-209ENST00000460297 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa29.91■■■□□ 2.38
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NME4-209ENST00000460297 CRY2Q49AN0 593 aa29.9■■■□□ 2.38
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NME4-209ENST00000460297 CEP126Q9P2H0 1117 aa29.83■■■□□ 2.37
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NME4-209ENST00000460297 VGLL2Q8N8G2 317 aa29.82■■■□□ 2.36
NME4-209ENST00000460297 MTFR1LQ9H019 292 aa29.82■■■□□ 2.36
NME4-209ENST00000460297 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
NME4-209ENST00000460297 A0A1B0GUL6 1792 aa29.81■■■□□ 2.36
NME4-209ENST00000460297 MX1P20591 662 aa29.81■■■□□ 2.36
NME4-209ENST00000460297 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
NME4-209ENST00000460297 PDE1AP54750 535 aa29.81■■■□□ 2.36
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