RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	HOXC9	P31274	260 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	13.34	□□□□□ -0.27	3e-6	■■■■□ 21.5
SSUH2-208	ENST00000455157		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		13.33	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.33	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	ANKRD1	Q15327	319 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	ST7	Q9NRC1	585 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	USP6	P35125	1406 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	MYL6B	P14649	208 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	HIP1	O00291	1037 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC27A2	O14975	620 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	GUCY1B3	Q02153	619 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	BEND3	Q5T5X7	828 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	JAK2	O60674	1132 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	NR1I2	O75469	434 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	POLA2	Q14181	598 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	BRF1	Q92994	677 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	TMX1	Q9H3N1	280 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	DLC1	Q96QB1	1528 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157		A0A0D9SFI3	127 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	ICE2	Q659A1	982 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157		A0A087WWV3	80 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	LTK	P29376	864 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	SDF4	Q9BRK5	362 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	ME1	P48163	572 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF75D	P51815	510 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	NECTIN1	Q15223	517 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	PROSER3	Q2NL68	480 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	CEP135	Q66GS9	1140 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	CFAP45	Q9UL16	551 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	PSME1	Q06323	249 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	GRM8	O00222	908 aa		13.27	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157		Q6ZUG5	572 aa		13.27	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.27	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	USP16	Q9Y5T5	823 aa		13.27	□□□□□ -0.28
SSUH2-208	ENST00000455157	CASQ1	P31415	396 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	TNR	Q92752	1358 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		13.26	□□□□□ -0.29

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