RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445427.1

PRKCQ-AS1-202, PRKCQ antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCQ-AS1, Length 1,133 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TMC4Q7Z404 712 aa27.56■■■□□ 2
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CDHR2Q9BYE9 1310 aa27.56■■■□□ 2
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KIF3CO14782 793 aa27.55■■■□□ 2
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CCDC152Q4G0S7 254 aa27.53■■■□□ 2
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MPNDQ8N594 471 aa27.49■■□□□ 1.99
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CTSWP56202 376 aa27.48■■□□□ 1.99
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 BEND3Q5T5X7 828 aa27.47■■□□□ 1.99
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LARGE2Q8N3Y3 721 aa27.47■■□□□ 1.99
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.46■■□□□ 1.99
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PPIP5K2O43314 1243 aa27.45■■□□□ 1.98
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ALDH1L2Q3SY69 923 aa27.45■■□□□ 1.98
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PTPRCP08575 1304 aa27.44■■□□□ 1.98
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 COL4A1P02462 1669 aa27.44■■□□□ 1.98
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FZD9O00144 591 aa27.44■■□□□ 1.98
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TTLL11Q8NHH1 800 aa27.43■■□□□ 1.98
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PLA2G12BQ9BX93 195 aa27.43■■□□□ 1.98
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CASP7P55210 303 aa27.42■■□□□ 1.98
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 COL4A5P29400 1685 aa27.41■■□□□ 1.98
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ALDH1L1O75891 902 aa27.41■■□□□ 1.98
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GREM2Q9H772 168 aa27.4■■□□□ 1.98
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LTBP1Q14766 1721 aa27.38■■□□□ 1.97
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SPEF2Q9C093 1822 aa27.37■■□□□ 1.97
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 POTECB2RU33 542 aa27.37■■□□□ 1.97
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 WASHC4Q2M389 1173 aa27.35■■□□□ 1.97
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZNRF3Q9ULT6 936 aa27.35■■□□□ 1.97
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FSTL1Q12841 308 aa27.34■■□□□ 1.97
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 POLLQ9UGP5 575 aa27.34■■□□□ 1.97
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GJA3Q9Y6H8 435 aa27.34■■□□□ 1.97
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SMC1BQ8NDV3 1235 aa27.33■■□□□ 1.97
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TBC1D16Q8TBP0 767 aa27.32■■□□□ 1.96
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HACL1Q9UJ83 578 aa27.32■■□□□ 1.96
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GGA1Q9UJY5 639 aa27.32■■□□□ 1.96
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 XDHP47989 1333 aa27.32■■□□□ 1.96
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 UFL1O94874 794 aa27.31■■□□□ 1.96
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HSPA6P17066 643 aa27.31■■□□□ 1.96
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FOXO4P98177 505 aa27.31■■□□□ 1.96
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