RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
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HOXD8-202ENST00000429017 CDCA8Q53HL2 280 aa9.09□□□□□ -0.95
HOXD8-202ENST00000429017 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.09□□□□□ -0.95
HOXD8-202ENST00000429017 ATG3Q9NT62 314 aa9.09□□□□□ -0.95
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HOXD8-202ENST00000429017 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9□□□□□ -0.97
HOXD8-202ENST00000429017 BCS1LQ9Y276 419 aa9□□□□□ -0.97
HOXD8-202ENST00000429017 TJP1Q07157 1748 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXD8-202ENST00000429017 SEMA3EO15041 775 aa8.99□□□□□ -0.97
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HOXD8-202ENST00000429017 CABP4P57796 275 aa8.99□□□□□ -0.97
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HOXD8-202ENST00000429017 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa8.98□□□□□ -0.97
HOXD8-202ENST00000429017 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
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HOXD8-202ENST00000429017 GMPRP36959 345 aa8.98□□□□□ -0.97
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HOXD8-202ENST00000429017 SKOR1P84550 965 aa8.98□□□□□ -0.97
HOXD8-202ENST00000429017 AMOTQ4VCS5 1084 aa8.98□□□□□ -0.97
HOXD8-202ENST00000429017 SULT6B1Q6IMI4 303 aa8.98□□□□□ -0.97
HOXD8-202ENST00000429017 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.98□□□□□ -0.97
HOXD8-202ENST00000429017 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
HOXD8-202ENST00000429017 NMRK2Q9NPI5 230 aa8.98□□□□□ -0.97
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.98□□□□□ -0.97
HOXD8-202ENST00000429017 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
HOXD8-202ENST00000429017 PCGF6Q9BYE7 350 aa8.97□□□□□ -0.97
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