RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 SH3TC1Q8TE82 1336 aa30.03■■■□□ 2.4
CTU1-201ENST00000421832 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
CTU1-201ENST00000421832 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
CTU1-201ENST00000421832 GYS1P13807 737 aa30.02■■■□□ 2.4
CTU1-201ENST00000421832 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
CTU1-201ENST00000421832 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 BAG6P46379 1132 aa30■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 SETDB2Q96T68 719 aa30■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 SIL1Q9H173 461 aa30■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 BECN1Q14457 450 aa30■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 PKNOX2Q96KN3 472 aa30■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 LAMB2P55268 1798 aa30■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 CSF1RP07333 972 aa29.99■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 LRRCC1Q9C099 1032 aa29.99■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 CTSWP56202 376 aa29.98■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 NFIXQ14938 502 aa29.98■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 ERFEQ4G0M1 354 aa29.98■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 TTLL11Q8NHH1 800 aa29.98■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 CASZ1Q86V15 1759 aa29.98■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 PDE8AO60658 829 aa29.97■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 COPRSQ9NQ92 184 aa29.97■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa29.97■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 RHPN1Q8TCX5 695 aa29.96■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa29.96■■■□□ 2.39
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CTU1-201ENST00000421832 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
CTU1-201ENST00000421832 RAB11FIP3O75154 756 aa29.95■■■□□ 2.38
CTU1-201ENST00000421832 GREM2Q9H772 168 aa29.95■■■□□ 2.38
CTU1-201ENST00000421832 ABCC12Q96J65 1359 aa29.95■■■□□ 2.38
CTU1-201ENST00000421832 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
CTU1-201ENST00000421832 CCDC24Q8N4L8 307 aa29.94■■■□□ 2.38
CTU1-201ENST00000421832 SASH1O94885 1247 aa29.93■■■□□ 2.38
CTU1-201ENST00000421832 SLC15A2Q16348 729 aa29.93■■■□□ 2.38
CTU1-201ENST00000421832 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa29.92■■■□□ 2.38
CTU1-201ENST00000421832 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP29.92■■■□□ 2.38
CTU1-201ENST00000421832 C3orf67Q6ZVT6 689 aa29.92■■■□□ 2.38
CTU1-201ENST00000421832 KIF1BPQ96EK5 621 aa29.92■■■□□ 2.38
CTU1-201ENST00000421832 CARMIL3Q8ND23 1372 aa29.91■■■□□ 2.38
CTU1-201ENST00000421832 CCDC57Q2TAC2 916 aa29.91■■■□□ 2.38
CTU1-201ENST00000421832 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa29.91■■■□□ 2.38
CTU1-201ENST00000421832 ITGA6P23229 1130 aa29.9■■■□□ 2.38
CTU1-201ENST00000421832 TM4SF1P30408 202 aa29.9■■■□□ 2.38
CTU1-201ENST00000421832 NYXQ9GZU5 481 aa29.9■■■□□ 2.38
CTU1-201ENST00000421832 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
CTU1-201ENST00000421832 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.37
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CTU1-201ENST00000421832 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.37
CTU1-201ENST00000421832 STK32BQ9NY57 414 aa29.89■■■□□ 2.37
CTU1-201ENST00000421832 CLCN1P35523 988 aa29.88■■■□□ 2.37
CTU1-201ENST00000421832 DDR1Q08345 913 aa29.88■■■□□ 2.37
CTU1-201ENST00000421832 LRRC24Q50LG9 513 aa29.88■■■□□ 2.37
CTU1-201ENST00000421832 TPTE2Q6XPS3 522 aa29.88■■■□□ 2.37
CTU1-201ENST00000421832 QSER1Q2KHR3 1735 aa29.87■■■□□ 2.37
CTU1-201ENST00000421832 ATG9AQ7Z3C6 839 aa29.87■■■□□ 2.37
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CTU1-201ENST00000421832 ERC1Q8IUD2 1116 aa29.87■■■□□ 2.37
CTU1-201ENST00000421832 COL4A1P02462 1669 aa29.87■■■□□ 2.37
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CTU1-201ENST00000421832 SALL3Q9BXA9 1300 aa29.87■■■□□ 2.37
CTU1-201ENST00000421832 CCDC125Q86Z20 511 aa29.86■■■□□ 2.37
CTU1-201ENST00000421832 SEC31BQ9NQW1 1179 aa29.86■■■□□ 2.37
CTU1-201ENST00000421832 SPEF2Q9C093 1822 aa29.84■■■□□ 2.37
CTU1-201ENST00000421832 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa29.84■■■□□ 2.37
CTU1-201ENST00000421832 EYA2O00167 538 aa29.84■■■□□ 2.37
CTU1-201ENST00000421832 TFCP2Q12800 502 aa29.84■■■□□ 2.37
CTU1-201ENST00000421832 TSHZ3Q63HK5 1081 aa29.84■■■□□ 2.37
CTU1-201ENST00000421832 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
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CTU1-201ENST00000421832 MSL1Q68DK7 614 aa29.83■■■□□ 2.37
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CTU1-201ENST00000421832 CNBD1Q8NA66 436 aa29.83■■■□□ 2.37
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CTU1-201ENST00000421832 ANTXR1Q9H6X2 564 aa29.83■■■□□ 2.37
CTU1-201ENST00000421832 FSD2A1L4K1 749 aa29.83■■■□□ 2.37
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CTU1-201ENST00000421832 CCDC152Q4G0S7 254 aa29.83■■■□□ 2.37
CTU1-201ENST00000421832 TAF7LQ5H9L4 462 aa29.83■■■□□ 2.37
CTU1-201ENST00000421832 NPHP1O15259 732 aa29.82■■■□□ 2.36
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CTU1-201ENST00000421832 PDE1AP54750 535 aa29.81■■■□□ 2.36
CTU1-201ENST00000421832 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
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CTU1-201ENST00000421832 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
CTU1-201ENST00000421832 LRP5O75197 1615 aa29.8■■■□□ 2.36
CTU1-201ENST00000421832 RTL9Q8NET4 1388 aa29.8■■■□□ 2.36
CTU1-201ENST00000421832 CIAO1O76071 339 aa29.8■■■□□ 2.36
CTU1-201ENST00000421832 MX1P20591 662 aa29.79■■■□□ 2.36
CTU1-201ENST00000421832 IL15P40933 162 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
CTU1-201ENST00000421832 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa29.78■■■□□ 2.36
CTU1-201ENST00000421832 AACSQ86V21 672 aa29.78■■■□□ 2.36
CTU1-201ENST00000421832 NLRP3Q96P20 1036 aa29.78■■■□□ 2.36
CTU1-201ENST00000421832 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa29.78■■■□□ 2.36
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