RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376180.7

ITGBL1-202, Transcript of integrin subunit beta like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGBL1, Length 2,494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGBL1-202ENST00000376180 FERMT3Q86UX7 667 aa22.97■■□□□ 1.27
ITGBL1-202ENST00000376180 MED23Q9ULK4 1368 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGBL1-202ENST00000376180 PSMA5P28066 241 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGBL1-202ENST00000376180 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGBL1-202ENST00000376180 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGBL1-202ENST00000376180 TTC6Q86TZ1 520 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGBL1-202ENST00000376180 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ITGBL1-202ENST00000376180 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGBL1-202ENST00000376180 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ITGBL1-202ENST00000376180 MYL6BP14649 208 aa22.95■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.95■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 CCDC192P0DO97 292 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 KLHL34Q8N239 644 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 RPS6KB1P23443 525 aa22.93■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 ZNF790Q6PG37 636 aa22.93■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 KRT85P78386 507 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 RNF20Q5VTR2 975 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 MRC1P22897 1456 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 PTGS1P23219 599 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 GCKRQ14397 625 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 MYD88Q99836 296 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 JCADQ9P266 1359 aa22.91■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 LIG1P18858 919 aa22.91■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.9■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 STK3Q13188 491 aa22.9■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 ANKRD1Q15327 319 aa22.9■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 COPS6Q7L5N1 327 aa22.9■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 COL15A1P39059 1388 aa22.9■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 IGSF3O75054 1194 aa22.9■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 FEZ1Q99689 392 aa22.9■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 TAF5LO75529 589 aa22.89■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.89■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.89■■□□□ 1.26
ITGBL1-202ENST00000376180 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.89■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 PDCP20941 246 aa22.89■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.89■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 ELP1O95163 1332 aa22.89■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 CHGBP05060 677 aa22.88■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 CAMK4Q16566 473 aa22.88■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 ERBB3P21860 1342 aa22.88■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.88■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.88■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.87■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.87■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.87■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 LUZP1Q86V48 1076 aa22.86■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 COPRSQ9NQ92 184 aa22.86■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 OGFRQ9NZT2 677 aa22.86■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.86■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 TFCP2Q12800 502 aa22.86■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 MAP3K11Q16584 847 aa22.86■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.86■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.86■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 ATP5JP18859 108 aa22.85■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 TNNI3KQ59H18 835 aa22.85■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.85■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 DRC7Q8IY82 874 aa22.85■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.85■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.85■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 JAK2O60674 1132 aa22.85■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.85■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.85■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 TYRO3Q06418 890 aa22.84■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 LRMPQ12912 555 aa22.84■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.84■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 SPATA32Q96LK8 384 aa22.84■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 DACT1Q9NYF0 836 aa22.84■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 USP16Q9Y5T5 823 aa22.84■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.84■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.84■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 ZNF609O15014 1411 aa22.83■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 SMTNL1A8MU46 457 aa22.83■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 PHKG2P15735 406 aa22.83■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ITGBL1-202ENST00000376180 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ITGBL1-202ENST00000376180 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms