RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330276.4

SV2B-201, Transcript of synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SV2B, Length 11,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2B-201ENST00000330276 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.65□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.65□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 SNCBQ16143 134 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 TTC16Q8NEE8 873 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 CXorf38Q8TB03 319 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 SOGA1O94964 1423 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 VAV2P52735 878 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 EVCP57679 992 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 ATP2B2Q01814 1243 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 KARSQ15046 597 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 KRT32Q14532 448 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 CCDC144AA2RUR9 1427 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 NLRP5P59047 1200 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 GUCY1B3Q02153 619 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 SLMAPQ14BN4 828 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 EFCC1Q9HA90 598 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 SEPT10Q9P0V9 454 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 LRRD1A4D1F6 860 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 KRT13P13646 458 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 TBC1D31Q96DN5 1066 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 THEGQ9P2T0 379 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 CCDC25Q86WR0 208 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 PALMDQ9NP74 551 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 EVC2Q86UK5 1308 aa6.64□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 GNAI3P08754 354 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 BIRC2Q13490 618 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 CCDC30Q5VVM6 783 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 PLVAPQ9BX97 442 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 SATB1Q01826 763 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 CFAP157Q5JU67 520 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 NEK11Q8NG66 645 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 TRPC3Q13507 836 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 EVA1CP58658 441 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 FYB2Q5VWT5 728 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 CCDC65Q8IXS2 484 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 STX6O43752 255 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 LIG3P49916 1009 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 SESN3P58005 492 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 C8orf76Q96K31 380 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 AACSQ86V21 672 aa6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 JAKMIP2Q96AA8 810 aa6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 ATP5DP30049 168 aa6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 WDR97A6NE52 1622 aa6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 ACTN2P35609 894 aa6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 E7EVH7 732 aa6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 MX1P20591 662 aa6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 TLDC2A0PJX2 215 aa6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 AKR1B10O60218 316 aa6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 GJB2P29033 226 aa6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 RASIP1Q5U651 963 aa6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 USP48Q86UV5 1035 aa6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 SPAG5Q96R06 1193 aa6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 HIP1RO75146 1068 aa6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SV2B-201ENST00000330276 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.62□□□□□ -1.35
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