RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.56□□□□□ -1.2
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LMO3-202ENST00000320122 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 MYO5BQ9ULV0 1848 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 UNC5CLQ8IV45 518 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 MNS1Q8NEH6 495 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 SLC27A2O14975 620 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 SOX12O15370 315 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 SKILP12757 684 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 RASEFQ8IZ41 740 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 JMYQ8N9B5 988 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 RGS22Q8NE09 1264 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 NEK1Q96PY6 1258 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 SDF4Q9BRK5 362 aa7.55□□□□□ -1.2
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LMO3-202ENST00000320122 KCND1Q9NSA2 647 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 ZSCAN12O43309 604 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 ME3Q16798 604 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 KSR2Q6VAB6 950 aa7.55□□□□□ -1.2
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LMO3-202ENST00000320122 LINS1Q8NG48 757 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 TIGD1Q96MW7 591 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 METP08581 1390 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 CAMK4Q16566 473 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 BEND3Q5T5X7 828 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 KCNH5Q8NCM2 988 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 NECTIN2Q92692 538 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 NCAPD2Q15021 1401 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 ANKARQ7Z5J8 1434 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 PI4KAP2A4QPH2 592 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 CTNNA3Q9UI47 895 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 TMEM2Q9UHN6 1383 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 TMCO3Q6UWJ1 677 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 FERMT3Q86UX7 667 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 HOMER1Q86YM7 354 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 LRRC8AQ8IWT6 810 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 KCNG4Q8TDN1 519 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 GTF3C6Q969F1 213 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 CCDC69A6NI79 296 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 SPDYE4A6NLX3 237 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 UBXN4Q92575 508 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 LMTK3Q96Q04 1460 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 LIG1P18858 919 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 CERKQ8TCT0 537 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 DDX11Q96FC9 970 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 ATF3P18847 181 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 NECAB1Q8N987 351 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 BRF1Q92994 677 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 AK7Q96M32 723 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 BPIFA3Q9BQP9 254 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 DACH1Q9UI36 760 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 RCOR1Q9UKL0 485 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-202ENST00000320122 A0A1W2PQ27 194 aa7.52□□□□□ -1.21
LMO3-202ENST00000320122 A0A1W2PQ64 194 aa7.52□□□□□ -1.21
LMO3-202ENST00000320122 A0A1W2PQD8 194 aa7.52□□□□□ -1.21
LMO3-202ENST00000320122 BTBD11A6QL63 1104 aa7.52□□□□□ -1.21
LMO3-202ENST00000320122 POTEB2H3BUK9 544 aa7.52□□□□□ -1.21
LMO3-202ENST00000320122 GRM8O00222 908 aa7.52□□□□□ -1.21
LMO3-202ENST00000320122 FOXO3O43524 673 aa7.52□□□□□ -1.21
LMO3-202ENST00000320122 HOXC9P31274 260 aa7.52□□□□□ -1.21
LMO3-202ENST00000320122 ME1P48163 572 aa7.52□□□□□ -1.21
LMO3-202ENST00000320122 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
LMO3-202ENST00000320122 STK38Q15208 465 aa7.52□□□□□ -1.21
LMO3-202ENST00000320122 OLFM4Q6UX06 510 aa7.52□□□□□ -1.21
LMO3-202ENST00000320122 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.52□□□□□ -1.21
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