RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 GPR108Q9NPR9 543 aa20.54■□□□□ 0.88
TVP23C-201ENST00000225576 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.54■□□□□ 0.88
TVP23C-201ENST00000225576 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.53■□□□□ 0.88
TVP23C-201ENST00000225576 TRIM37O94972 964 aa20.53■□□□□ 0.88
TVP23C-201ENST00000225576 BCORQ6W2J9 1755 aa20.53■□□□□ 0.88
TVP23C-201ENST00000225576 NTSR2O95665 410 aa20.53■□□□□ 0.88
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
TVP23C-201ENST00000225576 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.53■□□□□ 0.88
TVP23C-201ENST00000225576 RILPL2Q969X0 211 aa20.52■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.52■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.51■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 ZPR1O75312 459 aa20.51■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 LRRC24Q50LG9 513 aa20.51■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 CNTROBQ8N137 903 aa20.51■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 GREM2Q9H772 168 aa20.51■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.51■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.5■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 ADRA2BP18089 450 aa20.5■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 ITGA6P23229 1130 aa20.5■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.5■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 C4BP0C0L5 1744 aa20.5■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 CHMLP26374 656 aa20.49■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.49■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.49■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 SCN7AQ01118 1682 aa20.49■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 SMIM5Q71RC9 77 aa20.48■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.48■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 EP400Q96L91 3159 aa20.48■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 FAM177BA6PVY3 158 aa20.48■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 MSH5O43196 834 aa20.48■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 REC8O95072 547 aa20.48■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.48■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.48■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 ATP5JP18859 108 aa20.47■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 RTL9Q8NET4 1388 aa20.47■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 EVI5LQ96CN4 794 aa20.47■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.47■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 PLSCR1O15162 318 aa20.46■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 RFC4P35249 363 aa20.46■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.46■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 SETDB2Q96T68 719 aa20.46■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.46■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 NYXQ9GZU5 481 aa20.46■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.46■□□□□ 0.87
TVP23C-201ENST00000225576 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.45■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.45■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.45■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 USP26Q9BXU7 913 aa20.45■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 TXNRD1Q16881 649 aa20.44■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 MYH3P11055 1940 aa20.44■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF609O15014 1411 aa20.44■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.43■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 PROM2Q8N271 834 aa20.43■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 A0A1B0GUL7 405 aa20.43■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 PHF14O94880 888 aa20.43■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 SSFA2P28290 1259 aa20.43■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 TIMM10P62072 90 aa20.43■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 ERFEQ4G0M1 354 aa20.43■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.43■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.43■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.43■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 METTL24Q5JXM2 366 aa20.41■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.41■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 LAMB2P55268 1798 aa20.4■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 HIP1O00291 1037 aa20.4■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 APBA3O96018 575 aa20.4■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 HAUS7Q99871 368 aa20.4■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.4■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 LRP5O75197 1615 aa20.39■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.39■□□□□ 0.86
TVP23C-201ENST00000225576 BECN1Q14457 450 aa20.39■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.39■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.39■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 SGSM2O43147 1006 aa20.38■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 KIF2CQ99661 725 aa20.38■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.38■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.38■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.38■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 PDE8BO95263 885 aa20.37■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 ATP2B3Q16720 1220 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.7 ms