RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp646Q6NV66 1788 aa28.6■■■□□ 2.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rapgefl1Q68EF8 662 aa28.6■■■□□ 2.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mum1Q6DID5 682 aa28.6■■■□□ 2.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa28.6■■■□□ 2.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GpkowQ56A08 488 aa28.59■■■□□ 2.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nutm1Q8BHP2 1126 aa28.59■■■□□ 2.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc39a11Q8BWY7 342 aa28.59■■■□□ 2.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Setdb1O88974 1307 aa28.59■■■□□ 2.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scn9aQ62205 1984 aa28.59■■■□□ 2.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1700029H14RikE9PY36 240 aa28.58■■■□□ 2.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrch1P62046 709 aa28.58■■■□□ 2.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CpvlQ9D3S9 478 aa28.58■■■□□ 2.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slfn1Q9Z0I7 337 aa28.58■■■□□ 2.17
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Glt1d1A4FUP9 346 aa28.57■■■□□ 2.16
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eddm13E9Q7F5 164 aa28.55■■■□□ 2.16
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Il15P48346 162 aa28.55■■■□□ 2.16
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bend4P86174 541 aa28.55■■■□□ 2.16
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc38a10Q5I012 1090 aa28.55■■■□□ 2.16
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plekhg6Q8R0J1 787 aa28.55■■■□□ 2.16
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 InsrrQ9WTL4 1300 aa28.54■■■□□ 2.16
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eif6O55135 245 aa28.54■■■□□ 2.16
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Celf1P28659 486 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nlrp9bQ66X22 1003 aa28.54■■■□□ 2.16
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa28.54■■■□□ 2.16
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nrxn2E9Q7X7 1710 aa28.54■■■□□ 2.16
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Golgb1E9PVZ8 3238 aa28.54■■■□□ 2.16
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prl3d2F6R3P9 224 aa28.53■■■□□ 2.16
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Psmd1Q3TXS7 953 aa28.52■■■□□ 2.16
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plcd4Q8K3R3 807 aa28.52■■■□□ 2.16
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 IntuQ059U7 942 aa28.51■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Map9Q3TRR0 646 aa28.51■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Apbb1Q9QXJ1 710 aa28.51■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Skor1Q8BX46 964 aa28.5■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ly6iQ9WU67 134 aa28.5■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Carmil3Q3UFQ8 1375 aa28.5■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dcdc2bF7BCK0 340 aa28.49■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc14a2Q8R4T9 930 aa28.49■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Glis2Q8VDL9 521 aa28.49■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 EvplQ9D952 2035 aa28.48■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PgfP49764 158 aa28.48■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem143Q8VD26 458 aa28.48■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plekho1Q9JIY0 408 aa28.48■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tlr7P58681 1050 aa28.47■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf496Q5SXI5 585 aa28.47■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adora1Q60612 326 aa28.47■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Phf23Q8BSN5 401 aa28.47■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc51aQ8R000 340 aa28.47■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa28.47■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bin2D3Z6Q9 489 aa28.46■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ell2Q3UKU1 639 aa28.46■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tom1l2Q5SRX1 507 aa28.46■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc93Q7TQK5 629 aa28.46■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Chmp3Q9CQ10 224 aa28.46■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tceal9Q9DD24 104 aa28.46■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mical3Q8CJ19 1993 aa28.46■■■□□ 2.15
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Glis3Q6XP49 780 aa28.45■■■□□ 2.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Col3a1P08121 1464 aa28.45■■■□□ 2.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fgd1P52734 960 aa28.44■■■□□ 2.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pdzrn3Q69ZS0 1063 aa28.44■■■□□ 2.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rwdd1Q9CQK7 243 aa28.44■■■□□ 2.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Col1a1P11087 1453 aa28.44■■■□□ 2.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpr182P43142 395 aa28.43■■■□□ 2.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Jarid2Q62315 1234 aa28.43■■■□□ 2.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Phrf1A6H619 1682 aa28.42■■■□□ 2.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stk36Q69ZM6 1316 aa28.42■■■□□ 2.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tgfb1i1Q62219 461 aa28.41■■■□□ 2.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 WdpcpQ8C456 722 aa28.4■■■□□ 2.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dpp7Q9ET22 506 aa28.4■■■□□ 2.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc4a9E9PUP3 929 aa28.39■■■□□ 2.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MvpQ9EQK5 861 aa28.39■■■□□ 2.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa28.38■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ankrd44B2RXR6 993 aa28.38■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ftl2P49945 183 aa28.38■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CbarpQ66L44 698 aa28.38■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa28.38■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tnip1Q9WUU8 647 aa28.38■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sh3bp5Q9Z131 463 aa28.38■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rbm46P86049 533 aa28.37■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q8C5K5 320 aa28.37■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa28.37■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Brpf1B2RRD7 1212 aa28.36■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AppP12023 770 aa28.36■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gja3Q64448 417 aa28.36■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Klf15Q9EPW2 415 aa28.36■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sytl4Q9R0Q1 673 aa28.36■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plbd2Q3TCN2 594 aa28.35■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem87bQ8BKU8 555 aa28.35■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Aldh1l2Q8K009 923 aa28.35■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GabrdP22933 449 aa28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55 ms